军籍之停止，徭役之蠲除，租税之豁免，已是政府之一种特别优待法矣。然当时政府对于也里可温之尊崇，尚不止此。
《元史·世祖纪》：至元十九年四月，敕也里可温依僧例给粮。（卷十二）
《元史·百官志》：崇福司，秩〔从〕二品，掌领马儿哈昔、列班、也里可温十字寺祭享等事。至元二十六年置，延祐二年改为院。省并天下也里可温掌教司七十二所，悉以其事归之。七年复为司。（卷八十九）
教而领之以官，自北齐之昭元寺崇虚局始。北周有司寂以掌沙门，司玄以掌道门，唐初因之。其后乃特设崇玄署以司道教，而僧尼仍属诸祠部。至宋则僧、道又均隶祠部矣。此亦足以觇时代好尚之不同也。元制，礼部亦掌僧道，然有宣政院以专掌释教僧徒，秩从一品；有集贤院以兼掌玄门道教，秩从二品；而礼部之掌，遂有名无实。是可见元代对于僧、道之尊崇。顾也里可温之在元，亦为一种有力之宗教，特置崇福司，秩从二品，其阶级盖在宣政之下，而与集贤等也。教固不必以政府之尊崇为幸，然吾人考往史之遗迹，不得不备述其事实，以飨当世。释教尚寂，道教尚玄，基督教传福音，彼设官分职之命名，亦有取乎哉。
《元典章》：延祐四年七月，行省准中书省咨：“御史台呈：‘淮东廉访司申：“延祐四年正月三十日，有御位下彻彻都苫思丁起马四匹，前来扬州也里可温十字寺降御香，赐与功德主段匹酒等。照得崇福院奏，奉圣旨奥剌憨、驴驴各与一表里段子，别无御赐酒醴。彼奥剌憨者，也里可温人氏，素无文艺，亦无武功，系扬州之豪富，市井之编民，乃父虽有建寺之名，年已久矣。今崇福院传奉圣旨，差苫思丁等起马四匹，赍酒醴二瓶，前来扬州，传奉圣旨恩赐，是乃无功受赏。为此卑司今抄崇福院差劄在前，申乞照详。”得此，据见申本台看详，崇福院官当元止是奏奉御香，别无所赐奥剌憨酒醴，又不经由省部宣徽院（掌酒醴） ，有违定例。后有似此违例者，拟合钦依圣旨懿旨事意施行。仍令合干部分再行照会，相应具呈照详。’得此，都省咨请依上施行。”（卷三十六）
奥剌憨为扬州之富人，淮东廉访司之故与为难者，是否别有用意不可知。然所谓“素无文艺，亦无武功，市井编民”云者，固不足为辱也。基督徒之受辱于官吏，受侮于法利赛人（犹太经生） ，由来久矣，何有于元之廉访司、御史台？今得此一劾，而当时政府降御香于也里可温十字寺，及赐段子与也里可温掌教之故事，反藉此以传，考古者方深幸淮东廉访司之有此一举也。
《元史·文宗纪》：天历元年九月，命高昌僧作佛事于延春阁，又命也里可温于显懿庄圣皇后神御殿作佛事。（卷三十二）
所谓佛事，亦习用释家语，与《景教碑》之称僧称寺，今日本之称凡各教教徒为僧侣者一例。
《元史·顺帝纪》后至元元年三月，中书省臣言，甘肃甘州路十字寺，奉安世祖皇帝母别吉太后于内，请定祭礼。从之。（卷三十八）
甘州路之有十字寺，《马可游记》曾言之，曰“甘州者，唐古忒省之都会也。其城壮丽，其民大致皆奉偶像教，然亦有奉基督教及回教者。其地之基督教徒，于城中建大礼拜寺三所”云。
别吉太后，即显懿庄圣皇后也。（《元史》卷百十六） 后死后之事，既数与也里可温有关联，则后生前必为奉也里可温教之人矣。