宁玛巴（Rñin-ma-pa）意思是“古代的学派”，即藏族宗教自印度传来，没有被藏王朗达玛（836—842年在位）毁灭之前。就显教而论，根本没有区别，还是它原来的样子。但密宗则靠宗师亲口传授，因解释与注重点不同而发展成差别。在第二章谈到的“早期翻译”和“后期翻译”，作为学派的不同，已作了说明。这里不用详述历史的区别，我们可将宁玛巴作为当代制度来讨论，而分成下述各条：教育、学习地点、学术组织、学习程序、事务组织、公开大会，然后作些概述。
（一）教育
佛教可以分作九种教育（九乘）：
（1）对于学者一听就懂的声闻乘（Ñan-thos-pa）；
（2）通过自己的努力即可精通，而不必努力于旁人的利益即独觉乘（Raṅ-saṅs-rgyas或叫“清静无教佛”），得到启发即可由自己的努力而完善；
（3）像菩萨（Byaṅ-chub-sems-dpaẖ）那样找着推动旁人福利得到灵性觉悟；
（4）密教的教导关于外表的事续（Bya-baẖi-rgyud）；
（5）密教的教导关于内部也关于外部的行续（Spyod-paẖi-rgyud）；
（6）密教的教导关于“静观的宇宙灵性”即瑜伽续（Rnal-ẖbyor-rgyud或yoga）取得一致；
（7）大瑜伽（Mahā-yoga）；
（8）无二瑜伽（Anu-yoga）；
（9）无上瑜伽（Ati-yoga）。
前两者［（1）—（2）］属小乘（Hinayānā），余皆属大乘（Mahayānā）。前者只能救求者，后者则救多数。另外，前三者［（1）—（3）］属于显宗，即任何欲听者皆可听之，后者则属密宗，必得受密宗戒始可听诵。前三者［（1）—3）］是释迦牟尼，即转世佛或转世身所传授的，后三者［（4）—（6）］外表是密宗的，为金刚萨（Rdo-rje-sems-dpah-或Vajra-sattva）所传授。末三者［（7）—（9）］内部是密宗的，为普贤（Kun-tu-bzaṅ-po或Samantabhadra）所传授的。
六密宗佛教中，三种是外表上的密宗，由于藏族佛教各派都分享之，所以说它们是外表上的密宗。其他三密宗，则是内部的密宗，因为都属宁玛派的特点。他们修持的主要特点，是利用一般被放弃的东西，如怒、欲和什么属于身体的东西。在显教佛教看来，物质身体一般被认为是桎梏，是恶的渊薮，是精神所惧怕的东西，但在这里则被认为是方便法门，能够帮助精神取得丰富的完满的生活。这个积极的道路，是根据这样的信心，即人不能使自己离开污染而孤立生活，或不能树立虚伪的二分法，使生长的机体脱离营养它的东西，唯一的希望，是使两者同时提高到新水平，虽然这是对于一切密宗佛教都是真理，但宁玛巴则有三等内部密宗教导。
首先，“变异”（幻化部phrul）等于大瑜伽。相信每人自身内部都有与释迦等同的东西，但由于无知或偏见，一个人就会纠缠不清，在心理上会把不净的变净了；而在入静的过程中致使血管和身体旁的部分得到解脱，以致产生幸福、光明和无区别状态。这类教导，更进一步区分为论说（Rgyud-sde）和方法（Sgrub-sde）。
论说包括“在变异中的静与怒”（Sgyu-ẖohrul-i-khro）和“神密核心”或“论说王”（Rgyud-rgyal-gsaṅ-ba-sñiṅ-po），有五十八善静保护神，四十二愤怒保护神，一共有“一百个最高的善静保护神和愤怒保护神”（i-khro-dam-pa-rigs-brgya）。
方法是在论说的基础上实际的办法。方法包括崇拜“八保护神”（Sgrub-pa-bkaẖ-brgyad），那就是八成就方法。“八保护神”是：
前五者属于超世间的，后三者属于世间的。除马头明王注32是慈悲观音的化身（Spyan-ras-gzigs或Avalokiteśvara），其余均为妙音文殊（jam-dbyaṅs或Manñ-jughoṣa）的不同表现。在宁玛派中，胜德功菩萨则是八名的领袖（Gtso-bo），也是九名的领袖，即添上智慧保持师（Rig-ẖdgin-slob-dpon-lha），他的供桌以“苦海”为象征，他的作用，是取消五毒现象，集中五种智慧在一起。
胜德功的像有二十一头，三头一排，七排递升。二十一头代表显密两教圆满道注33二十一级。七层则代表菩提道注34七部分。脸有不同颜色，红指热心，白指干净，蓝指有恒，绿指安静、可怕、发展、努力等，黄指一切成就圆满，而多种颜色则指一切现象的综合。
四十二只手臂表示多种静态，一只手拿着一种静态的面目。两肩上有两翅膀，左边的表示方便，右边的表示智慧；如同神王与女伴侣一样，有八条腿，每只脚踏在一个魔王和一条龙上，八条腿表示解脱的八条路，而八神王象征八识，八龙则象征八种心意，伴侣拥护着他，名字是杜谋杜哲那谋（Gtum-mo-dug-brul-nag-mo），表明她是贪、嗔、痴这三个大敌的摧毁者。
回到方法方面，有一个区别，即由印度来的大师直接口述的（Bkah-ma）和由地下发现的埋藏文字（Gter-ma）而传到后代的。由于不同师传有不同注重点和不同处理方法，结果就产生了主要两种学派，即口述传统（Bkaẖ-ma）的主要两种学派：索路（Zur-lugs）和绒路（Roṅ-lugs）。著名的索路派大师有索伯切（Zur-po-che，1002—1062年）、索穷巴（zur-chuṅ-pa，1014—1074年）和卓普巴（sgro-phug-pa，1074—1134年）。绒路来源于绒苏母勤伯趋吉臧伯（Roṅ-zom-chen-po-chos-kyi-bzaṅ-po），与宋仁宗（1023—1063年）同时。
最早发现埋藏文字的人是宋高宗时代（1127—1162年）娘（Ñaṅ）地的尼玛窝色（Ni-ma-ẖod-zer，1124—？）。以后宁宗（1195—1224年）和理宗（1225—1264年）时代又有古儒曲吉旺去（Gu-ru-chos-kyi-dbaṅ-phyug）继续有所发掘。两种发掘所得，叫作“上下宝藏”（Gter-kha-goṅ-hog）。以后陆续有较小的发掘，以致最后到明孝宗（1488—1505年）时，拉提那灵巴（Rata Glin-pa）将这些发掘与他自己的大量发掘的著作编在一起，叫作“南方宝藏”（Lho-gter）。在明世宗时（1522—1566年），北方统治家族中出现一位大师叫作瑞金过及得曲尖（Rig-ẖdzin-rgod-kyi-ldem-ẖphyul-can），他又有许多发掘，并编出“北方宝藏”（Byaṅ-gter）。
在神宗时代（1573—1619年），扎喜拖甲（Bkra-çis-stobs-rgyal）创立了多吉扎（Rdo-rje-brag）寺，宣讲“北方宝藏”，而在17世纪中叶居梅多吉（gyur-med-rdo-rje）创立敏卓灵（smin-grol-gliṅ）寺，宣讲“南方宝藏”。有了这两个学府，两个学派就确立了。但它们不只限于宣讲“宝藏”，也同样教导由印度大师通过口述传下来的教法。此处无妨附带说一下所谓“宝藏”的发掘。佛教的典籍，因为藏王朗达玛时期的压迫而有埋藏，这是很自然的。自然也会有关于某些埋藏的实际发现。可是为了佛教的复兴，以及后来各派的竞争，也就难免有人创造典籍，并埋藏它们，后又重新发掘它们，就像本教“宝藏”一样。无论如何，所有“宝藏”都被认为其来源是超自然的。为了使个人的根据取得较高威信而宣称其古老，乃是通常的动机。
三种本身密宗的说教的第二类，是“集聚”（dus）类，相当于阿努瑜伽（Anu-yoga）。这一类的主要论述是“普遍集聚知识”（kun-ẖdus-rig-pa）和“集聚神秘认识”（Dgons-pa-ẖdus-pa）。在心理创造和辨认双重过程中,辨认或与护身一致常被加重。这种可能性，主要是用自己的血管和精虫取得完全一致目的，以便产生幸运、光明和无私。有两种教导，都由印度大师流传而来，也自发现的“宝藏”中来。
第三类只是关于“心”的，与阿提瑜伽（Ati-yoga）等同。它废除了形象和内部能力，那是上述说教的两类的特点，而这里关心的是体现心的本身。汉传佛教的禅宗（Dhyāna）在这方面与之类似。然而宁玛巴独特之处，乃是修得的方法，即叫作“胜过最高者”（Thod-rgyal）。用这种方法，可以得到自明，即身体可在虹中消失，或虹的颜色中消失，以便得到解脱。论述与发现的宝藏，都是说教的根据。可是这些说教，又分成三小类。
第一小类是关于心（sems-sde）的，即怎样体现自身与外界的本性，而不被假象所迷惑。这一类主要论述的是“空中的卡辱达鸟”（Khyuṅ-chen-ldiṅ-pa），“普善王”（Kun-byed-rgyal-po）和“大圆满”（Rdzogs-pa-chen-po）。
第二小类是飞入神秘自在部（Kloṅ-sde）。经过上述体现后，一切障碍和偏见都没有了，以至于心中除光明以外，再无别物。心是完全自由的，有金刚桥（Rdo-rje-zam-pa）的教导，也有主要经典《不焚力》（Bya-rtsol-me-pa）。
第三小类是教授部（Man-ṅag-gi-sds）。当心完全自由的时候，则有“觉悟”，身体可在虹中消失。此类的说教，包括“四实质”（Sñiṅ-thig-ya-bi）；主要经典包括《莲华无上权能》（Padma-dbaṅ-rgyal），《佛平等》（Saṅs-rgyas-mñam-skyor）和《回声全》等（Sgra-thal-ẖghur）。
（二）主要学习地点
现在还起作用的最主要的学习地点，在西藏有敏卓灵（Smin-grol-gliṅ）和多吉扎（Rdo-rje-brag），在西康有噶托（Ka-thog）、白玉（Dpal-yul）、佐勤（Rdzogs-chen）和西勤（i-chen）。西康四寺院中，前三寺最重要，可与西藏格鲁巴三大寺齐名，即色拉（Sa-ra）、哲邦（bras-spuṅs）和甘丹（Dgaẖ-ldan），分别于1418、1416、1409年建立注35。此处宁玛巴以年代先后作记载，以便与较小寺院作为比较，虽不太重要，但有历史意义。
本书前两章提到的桑耶寺（Bsam-yas或Sam-yas）是在西藏建立的第一个佛教寺院（762—766年），那是藏王赤松德赞当政时期。班马撒姆巴瓦（Padmasambhava）和山塔绕克西塔（Śantarakshita）这样有独到见解的大师，就在那里宣讲佛法。不只密宗佛教第一次的系统翻译在那里进行，而且本教徒也在那里集聚，将他们的说教写成文字。
奇姆普（Mchinm-phu），作为桑耶寺的退休地点，也是同一藏王当政时期建立的。宁玛巴传统中最著名的人，即在初、中、末期三阶段翻译最著名的人，是捏年那古麻拉（Gñags-jñāna-kumāra），与赤松德赞同时；努桑接伊西（Gnubs-saṅs-rgyas-ye-çes），在第九世纪；索伯切沙佳迥内（Zur-po-cheça-kya-ẖbyuṅ-gnas，1002—1062年），都以此作为教导生徒的地址。索伯三大师，在上面方法上提到的，即有最后一名；其他二名，也曾在此处传道。可是三人作为旁的寺院的创始人，更为著名。
五巴龙（Hug-pa-luṅ）为索伯切所创立，后为索穷巴（Zur-chuṅ-pa，1014—1074年）和索下加僧格（Zur-çakya-seṅ-ge，1074—1134年）所代替，后者又创建卓普寺（Sgro-phug），后来便以卓普巴见称。
西康德格（Sde-dge）的噶托（Ka-thog）寺，为卡当巴德谢（Bkaẖ-gdams-pa-bde-ggege，1122—?） 注36所建立，他是帕谋主巴（Phag-mo-grub-pa，1110—1170年）的弟弟；而帕谋主巴则是属于噶举巴（Bkaẖ-brgyud-pa）或叫白教的。那是宋高宗当政的时代（1127—1162年）。他也是卓普巴（Sgro-phug-pa）的徒孙。他吸收许多埋藏的宝藏，所以与敏卓灵（Stain-grol-gliṅ）同属一个教派，叫作“南方宝藏”派。可是噶托的创始人不只是宝藏派，他也传授了印度大师的遗教，只是宝藏更为重要罢了。噶托寺有550名喇嘛，为追没兴窘（Dri-med-iṅ-skyoṅ）大喇嘛所管。
不丹的塔巴岭（Thar-pa-gliṅ）寺，是追梅窝塞（Dri-med-ẖod-zer，133—1363年）建立的，那是他到不丹旅行的时候。后来宁玛巴又由不丹传入尼泊尔。
多吉札（Rdo-rje-brag）是西藏“北方宝藏”学习的中心，起源于埃窝曲卡（E-wam-chos-sgar）的聚会，而该聚会是扎喜拖甲（Bkra-çis-stobs-rgyal）所组织的。扎喜托甲是西藏拉堆泽地方的土司，后因失势而至前藏。寺院则正式起始于巴玛春雷（Padma-hphrin-las）的创建，而巴玛春雷则是扎喜托甲的儿子那吉旺曲（Ṅag-gi-dhaṅ-phyug）的转世。第五辈达赖（1617—1682年）对于此寺十分羡慕。它由于准噶尔入侵而被毁，但不久即恢复。
西藏的“南方宝藏”传授地点敏卓灵（Smin-grol-gliṅ），创建于明思宗（1628—1643年）最后两年，为居梅多吉（gyur-med-rdo-rje）和那旺曲巴（Ṅag-dbaṅ-chos-dpal）二人所建。二人之后，继承人是达玛释瑞（Darma-çri），这个寺院，也跟多吉札一样，由于准噶尔入侵而被毁，以后又被修复，时间也相同。
佐勤寺（Rdzogs-chen），意为“大圆满”，在西康德格，是1685年由班玛日津（Padma-rig-ẖdzin，1625—1697年）所建。他是被德格土司阿旺扎喜（Ṅag-dbaṅ-bkra-çis）由金沙江西边请过来的。现在这个寺院在宁玛巴中最受崇敬，不只在西康，而且在不丹、尼泊尔也有吸引力，聚集的徒众达五百人以上，主持寺院的是创始人的转世。
白玉寺（Dpal-yul）也属德格范围，与佐勤寺同时，为日津昆臧西饶（Rig-hdzin-kun-bzaṅ-çes-rab）所建。也跟佐勤寺一样，属敏卓灵系统，僧众约有六百人，寺主是噶玛洋斯（Karma-yaṅ-srid）。
西勤寺（i-chen）．离佐勤寺不远，是1764年或后一点，由佐勤寺发展起来的。它的创始人是西勤饶将巴（i-chen-rab-ẖbyams-pa），有僧众约百人，但与佐勤寺的关系，似乎不协调。
（三）学术组织
抛开西藏宁玛巴寺院不谈，只有西康的噶拖（Ka-thog）、白玉和佐勤有学院，称为札萨（Grwa-sa）。早先，这些寺院都是密宗的，专重个人修持，不讲言传，特别是它们的大圆满（Rdzogs-chen）理论，与禅宗相似；上面已述，重点放在内省见解，而不放在传达知识方面。但这种修持，只对最有天才的人才有用，至于普通智慧，必须有理论的准备，才能有直接的了解。另一方面，为了与格鲁巴竞争，也必得注重可以传达的知识。一个多世纪以前，佐勤寺院创立了一个学术学院制，叫作师利辛哈罗札（Śrisiṁha-slob-grwa），为格芒显盘塔耶（Dge-maṅ-gan-phan-mthaẖ-yas）倡导下创立的，以便正式传授显教和密教。以后大学院（Slob-chen）加在聚会楼上，以与前章所述的格鲁巴三大寺，即色拉、哲邦、甘丹做比较。教学内容，包括释迦佛语和他的印度门徒解释的翻译，加上宁玛巴大师的阐述。
约当19世纪末叶，司徒曲吉嘉木错（Si-tu-chos-kyi-rgya-mtsho）也在噶托（Ka-thog）创立了一个教学学院。早先建立的是续部学校（Rgyud-sde-khaṅ），虽然名字是密宗佛教的意思，但它不完全限于密宗。不如说，学校起了这个名字，是因为大厅内有大量的密宗佛像。事实上，这个学校分成两个学院，教学学院（Bçad-grwa）和训练学院（Sgrub-grwa），前者给正式关于显宗佛教和密宗佛教的理论，当学徒精通这些理论后，即可进入密宗成就实际训练，如“灌顶、传承和讲解”（Dbaṅ-luṅ-khrid-gsum）。这个组织，在昆臧贝（Kun-bzaṅ-dpal）领导下，得到进一步发展。昆臧贝是洛坚丹津诺布（O-rgyan-bstan-ẖdzin-nor-bu）的徒弟。在这些学院以外，顺序学院（Sgrig-grwa）得以建立。为了普通僧人，他们既不关心理论的讨论，也不关心个人的成就，可是必须在仪式的作用上，在寺院的法规上及格。
在20世纪20年代初期，白玉的棍桑（Mgon-bsam）大喇嘛，建立了三学院，在他自己的寺院中，仿照上述两个寺院的规模。
大喇嘛（Bstan-bdag）或活佛（Sprul-sku）在每个寺院都是校长；在校长以下，又有院长或教授（Sprul-po），主管哲学讨论、实际辅导和宗教仪式。
每个寺院的徒众人数取决于供给的来源和数目，例如寺院分配的全份助学金和部分助学金，宗教活动收入，供给的来源有布施、生徒家庭个人的供给，如佐勤寺即由不丹王奉送的60驮印度绸中，发给60全份奖学金，平均分配给教学和训练两学院的徒众。每一项助学金都用实物交付，即两袋青稞大麦（合140斤），30斤酥油。
在三学院内，约有四五十名徒众在教学学院，十余人在训练学院。在佐勤寺的训练学院，特别有十三名受圆满戒的喇嘛，叫作“十三名净者”（Tshaṅs-pa-bcu-gsum）。
在教学学院至少要学习五年，训练学院要学六年，在受戒学院年限不一定。但学习年限可以根据学员的要求延长以便深入钻研。有的笨学生在教学学院可以停留十年以上注37。
六七岁孩子，可以被送到寺院，跟教师（Dge-rgan）先学习藏文字母，再学习拼音，然后学习造句，叫作初学者（Grwa-chun）或噶卡巴（Ka-kha-pa），即由藏文字母开始的人。然后他跟讲师或教授学习必要咒语，以及在宗教仪式中的赞颂词。到16岁以后，才可剃头，作为预备僧侣（Dge-tshul-gsar-pa）。到了20岁上下，正式受三十六戒，叫作给催（Dge-tshul或Śrāma-ṅera）或正式学生（Grwa-pa）。在这以后，他便可以参加教学学院做旁听生，他正式做喇嘛（Dge-sloṅ或Bhikṣu），即在受了二百五十三戒，成了“教学学院的学生”（Bslab-grwa-pa）后，他的正规入学才算数。一到正规入学，他便可以把教师讲解的宗教著作，通过考试（Rgyugs-len）确认成绩。当他经受这等内容很多的考试后，他的学业必定有了长足的进步，这时，他便是学生助教（skyor-dpon），可以帮助同学进行学习。直到最后经过考试，他便算由教学学院毕业。他如考试最优，便得“饶将巴”（Rab-ẖbyams-pa）的称呼，那就是相当于博士的学位，得到三项奖品，即一个金刚杵，一个金刚杵铃和一身喇嘛服。少数次优的，获得次要的奖品，直到一般毕业而没有奖品。至于最后考试不及格者，有时会被拴在经堂门前的旗杆上示众。
从教学学院毕业以后，才有资格入训练学院，做一个“训练学院的学生”（Sgrub-grwa-pa）。当训练学院的学生，不同程度的突出自己，则可取得“自善喇嘛”（Sgrub-po-bla-ma）和“善教喇嘛”（Sgrub-po-dpon-bla-ma）的称号。头一个称呼是说他自己进修有成绩，后一个称呼是说教别人有成绩。及至两种学院毕业以后，即得教授（Mkhan-po）级，说明不仅在学术上，而且在灵性上，都是可观的。在这以后，他可以留在寺院教生徒，也可以到本寺院统治之下的分寺院去当长老。
试举佐勤寺为例来说明这样的教授的特殊的地位。一个人一旦当了教授，在一生中便放弃了乞求布施的权利，而“活佛”和旁的喇嘛则可自由接受布施。另外，寺院有两种选择后继人的办法：一种是一代一代地传下去，一种是选择领袖不限出自何方，换句话说，即学制的混合，一面由自己培养的，一面由外来的。有四种教学组织，那里的教授是选来的，他们必须得到与会听众的信任，不但在知识方面，还要在人格方面。他们不必是自己学院的毕业生。也有三种组织注38，两种是显教的（所谓“大学学院”和获得全份助学金的学院），一种是密教的（在雪山上的一个组织），他们的教授必须是宁玛巴的本寺直接出来的学生。属于密宗的各种宗派都可前来参加学习。而属于显宗的各种宗派的人，都可来佐勤向佐勤的人挑战，举行公开辩论；一般是进行辩论的人要向寺院当局宣布辩论题目而且注册，以便按顺序得到讲坛，举行演讲，并与旁人举行辩论。
（四）学习程序
在教学学院，学习释迦佛教导和显密两教的注释。先学显教，显教有十三部著作：
（1）《达到自我解放》（So-sor-thar-pa或Prālimokpa）；
（2）《寺院法规纲要》或《律经根本颂》（dul-rtan或Vinaya-mūla）；
（3）瓦苏班杜（世亲）（Vasubandhu）的《阿毗达磨俱舍论》（Abhid-harma-kopa或mnon-mdzod）；
（4）《阿毗达磨论集》（kun-las-btus-pa或Saṃgraha）；
（5）《中观根本颂》（Dbu-maẖi-rtsa-ba或Madhyamaka-mūla）；
（6）《入中论》或《入中观论》（Dbu-ma-ẖjug-pa或Madhya-makāvatāra）；
（7）《四百论》或《中观论》（Bi-brgya-pa或Catuh-ataka-śastra-kārihanāma）；
（8）《入菩萨行》或《入行论》（Spyod-ẖjug或Bodhisattva-carya-avatāra）；
（9）《现观庄严论》（Mṅon-rtogs-rgyan或Abhisamayālaṃkāra）；
（10）《辨中边论》（Dbu-mthaẖ-mam-ẖbyed或Madhyānta-vibaṅ-ga）；
（11）《辨法性论》（Chos-ñid-mam-ẖbyed或Dharmatā-vibhaṅ-ga）；
（12）《究竟一乘宝性论》（Rgyud-bla-ma）；
（13）《大乘庄严论》（Theg-chen-rgyan或Mahāyāna-sūtra-alamkāra）。
这些可以分为四类：寺院规程、小乘的研究、大乘研究中的实体部分和大乘研究中的现象部分。除了寺院规程外，其余仍可以分为理论与实践两部分。在实际上，十三种著作有的可以认真学习，有的不必认真学习。以卡托寺为例，下面的学习顺序可以注意：
（1）《菩提道入门》（spyod-ẖjug或Bodhi-saūracarya-aratāra）；
（2）《寺院规程诗句》或《法句经》（Tśig-lah-ur-bcad-pa或Vinaya-kārikā）；
（3）阿里班勤（Mṅah-ris-paṅ-chen）著《三种寺院规程清解》（Tri-saṃvara-vinya或Sdom-gsum-mam-ṅes）；
（4）弥勒（Maitreya）《慈氏五论》（Byams-chos-sde-lṅa）注39；
（5）《寺院规程基础》或《律经根本颂》（dul-rtsa或Vinaya-mūla）；
（6）《中观基础》（Dbu-maẖi-rtsa-ba或cafuhafakaāsfrakārika-nāma）；
（7）《入中观论》；
（8）《四百论》或《中观论》；
（9）关于中观旁的收集品。
除了翻译印度原始著作外，学生也接受宁玛派学者的指导。
佐勤一年有三个月专门讲述上面的十三著述，听众都具有较高的水准，虽然来人数目不定。除了上述十三著述外，还加上：《密教要点》（Gsaṅ-ba-sñiṅ-po或Guhyagarbha）和追梅窝塞（Dri-med-ẖod-zer，1308—1363年）及千才沃塞（Mkhyen-brtse-ẖod-zer，与清乾隆同时，而乾隆统治是在1736—1795年）的著述，如功德藏（Yon-tan-mdzod）和如意藏（Yid-bin-mdzod）。
在佛教显教教完以后，即在教学学院进行密教教学。首先，《密教要点》和《转化坛抓》（Sgyu-ẖphrul或Māyā），按着苏尔禄（Sur-lugs）进行讲解，那是各派都一致的。其次，再用让禄（Ron-lugs）注释进行讲解，那是不同派（Mthun-moṅ-ma-yin-pa）所共有的。再其次，按着龙钦饶将巴（Kloṅ-chen-rab-ẖbyams-pa，追梅窝塞的别名）解释再加讲解，而用下述著作为补充教材：《七宝藏》（Mdzod-bdun）、《三松弛》（Ṅai-gso-skor-gsum）、《三解脱》（Raṅ-grol-skor-gsum），都是绝对不与它派（Çin-tu-mthun-moṅ-ma-yin-pa）共同的。
一个学生能够清清楚楚地了解显、密两教的著作，他就有资格入训练学院，并住六年。第一个三年，他被教以授权仪札（Dbaṅ）、教训（Luṅ）、护理教导（Khrid），以为后来自我发展的基础——那就再需要三年，所以有这样的话：“一人停三年在明处，再停三年在暗处。”因为个人宗教的自修，是在暗室。
进修的次序，第一是保护神的样子用心理创造出来，办法是自念经典而且默想在心中兴起的形象；第二，用心理的身体控制自己的血管、精体，等等；第三，实感到自己的内心真实性质。
为练习前两项，须靠“三个基础”（Rtsa-ba-gsum），也就是自己的师傅（Bla-ma）、保护神（Yi-dam）和智慧女神（Mkhaẖ-ẖgro或Ḍākini）。修持者必须熟习对他们默念和对他们诵经。
为了实行第三，学者必须靠着“教诲”（Khrid-yis）。这又分作两部分：第一部分，是预备（Sṅon-ẖgro）；第二部分才是“教诲”（Dṅos-gi）本身。预备，一般包括巴追尔（Dpal-sprul）的“教导自撒满擦抓”（Samantabhadra），那是跟宗喀巴的“菩提道次第”类似的，可在学生进入密教佛教之前得到学习、教诲。对于不同学生，进行不同的教诲，近来常是根据“最高智慧大全”。
一个学生由训练学院毕业以后，如果他同意，即有资格作为教授，假定他还要追求自我进一步发展，他可以到处旅行，拜访更高明的师傅，以便得到更高的指导。
（五）事务组织
学术组织和事务组织，都在寺院的大喇嘛（Bstan-bdag）集中管理之下，大喇嘛则永远是个活佛（Sprul-sku），尽管一个寺院里有许多活佛没有行政职务。—个寺院的事务组织，可分两部分，即宗教组织和行政组织。
寺院事务组织中的宗教部分，是在大喇嘛、教授（Mkhhan-po）和主要祭司（Rdo-rje-slob-dpon）管理之下。祭司主持宗教仪式，他不但需要在个人进修上，还要在学问上和人格上都及格；在他之下，还有好多领诵的（Dbu-mdzad），一些献祭的助手（Mchod-dpon）和一名训导（Chos-khrims）。训导不只是出席宗教仪式，而且所有不同学院都有一名训导，管理僧众遵守行动规范。在寺院的主要经堂以外，有特别为护法神设的神殿，也有专为这种神殿配备的僧侣，进行管理。
寺院事务组织中的行政部分，在大喇嘛和一名摄政（Dgon-dpon）管理之下，摄政职务由一长老（Rgan-pa）委员会分担；在委员会之下，另有一群助理派遣员，有一名会计（Phyag-mdzod）直接归大喇嘛管理，对大喇嘛私人财产和寺院公共财产负责；在会计之下，有一名干事（Gñer-pa）和二十名左右的记账员（Spyi-pa或Spyi-gso），实际管理一切财产，或投资商业，或放债给外人，取得利息。盈余或利息，即用作寺院的修缮、塑像，做刻版印经、补助学生，进行宗教仪式、救济、处理死者。收入的来源是牲畜、经商、地租或由信徒捐款。
一切办公的职位，都是由大喇嘛选派僧众来担任的，任期或三年、四年、五年不等，因为任命完全根据寺院僧众的选举提名，然后才由大喇嘛任命的，职员可以连选连任，来为僧众服务。
职员不止于由个人服务，照例由执行委员会考虑公众问题，或一个委员会进行一种任务，或几个委员会联合商讨共同问题，所以事务组织，既有民主，也有独裁，两者兼而有之。另外，为了保护寺院的福利，不被外部事务侵扰，某些重要人物，如土司之类，常被请来作为外界保护人，或世俗“护法”。
（六）公开大会
公开大会是寺院仪式的一部分，可是每日在寺内做的仪式，不为群众所关心，只有大规模的仪式，而且常是化装有特殊服饰的，才吸引外界观众。这些不只满足宗教要求，而且为群众和僧侣提供娱乐机会，常视季节的重要性，趁公开大会之便，进行大量商业和经济活动。公开大会的日期各寺可以不同，但基本有如下列：
正月初一新年节（Lo-gsar），举行大祈祷会。
正月十八、十九两日是金刚杵（Phur-pa或Vajrakilaya）预演神圣舞蹈，叫作小杵（Phur-chuṅ）。二十八、二十九两日正式演出大杵（Phur-chen）。有的寺院，金刚杵不被演出，而以“一百最高安静和愤怒保护神”，也就是本章一开始所说的大瑜伽出来表演。只有在大寺院，才有条件进行这样大规模的表演。
二月二十二日，举行崇拜舞蹈（Sgrub-mchod），化装八十方法保护神，那也是以前提到过的。
三月举行的向山神、水神（Bswo-yul）献礼，祈求地方的平安和福利。
四月初一到十五，是默斋（Smyuṅ-gnas）期间，祷念十一面观音，对受戒的僧人来说，在此期间有个受戒机会。
六月或七月的初十，有十日礼（Tshes-bcu），用舞蹈表现班马撒姆巴瓦（Padmasambhava）八化身。据说这位大师喜欢每月十日到人世间来，造福于人类。所以他在西藏的信徒才创立了“十日礼”。理论上，任何十日都可以，可是遇着年、月、日都用十二属相注40的猴来代表，那个十日特别好。所以每月初十，都有宗教的纪念日，但遇到猴年、猴月、猴日那个十日便举行舞蹈。
九月十八、十九日，举行降伏魔鬼典礼（Tinga-sgral）。相信一切佛教的敌人，都被制伏在大麦与糌粑所造的花中（Gtor-ma）。在舞蹈中，将花毁掉，象征将敌人毁掉注41。这种典礼，可以在任何一年的舞会举行，叫作“毁掉酥油糌粑花”（Gtor-ma-bcad）。
十一月十四、十五两日，举行冬至典礼（Ñi-log）。
十二月二十九日举行典礼，纪念年末月末（Lo-zad-zla-zad-dgu-gtor），意思是季节这样幸福度过，神祇应受表扬，活物应得物品。所以为了自利，也为了利他，祈祷平安与赐福。
（七）一般总结
教派的不同，通常被了解较少的人所夸大；有学问的喇嘛的看法则不是如此，因为在他们看来，教派的不同不过是学者不同的水平要求不同的满足方法而已。先天的遗传和后天的文化既对所有的人不相同，则要充分发展一个人的人格即有不同的方法。为了给每个人一个机会，佛教才给各种方法和观点以适应不同的要求。可是归根结底的目的则永远是最后解脱。小乘（Hinayāna）是为了个人解脱的；而大乘（Mahāyāna）则使个人有可能帮助旁人解脱。这乃是尽人皆知的事。
至于显教和密教的教导，则不是那样容易理解的。为什么要有密教?因为对于没有准备则无法理解的人，容易误解。耶稣曾经说过，对于公众，他用比喻；对于门徒，则说实话。这不但对于每种宗教如此，就是日常说话也要看听话的人理解能力如何。但代表后期印度佛教的藏族佛教中，有许多怪异的神像，特别是男女拥抱的神像，以致产生各种误解。这些神像，有的学者认为是原始性崇拜的遗留。在任何宗教中，都可追溯阳物崇拜的各种表现。基督教每餐向上帝祈祷，也可说是原始文化的遗留，当时人类对于自然的控制，还实在有限，不能保证饮食有充足的供应。可是这样的历史解释，不能满足现代生活中耶稣教徒对于祈祷的作用。所以，不管密宗佛教有多少原始的内容，也不能帮助我们了解今日的喇嘛在练习密宗时实际的心理过程。
根据有学问的喇嘛的解释，显宗佛教是一种弃世之道，可以求得智慧，以知现象世界的不善和无常。那是努力提升自己，不受由母体中出生而有物质限制。密宗佛教，不管是否起源于原始状况，在理论上则较显宗为进步。因为凡已有者均视为固然，而将已有加以利用，以求得理论认识和灵性发展。所以提升的过程，不再是物质身体的放弃，而是利用物质身体。所以密宗教徒嘲笑显教的唯心论者，说放弃物质身体等于追求影子，放弃造成影子的东西，不承认那个东西，一旦物体与心灵的矛盾被承认，便永远纠缠不清。不管是物质还是心灵，有一方特别重要，就纠缠不清。假如任何一方作为出发点，都视为“固然”，视为“本性”，则可对于任何事物没有偏见，没有误解，一视同仁。当一个人没有偏见、没有误解的时候，则他是“自由”本身，这就是解脱或得救或永存的意义。根据密宗经典的一段话：“好徒众，基本上任何是就是是。本性，包括你自己，本来不是纠缠的，为什么要避免纠缠呢?本来不被诱惑的，为什么要避开它寻求真理呢?”另一段说道：“行为而没有了解，是盲目的；了解而没有实践，是浅薄的。当二者为一，便有自我控制。”这个自我控制，自然不是抑制，而是自由。任何懒人都不能享受它。那是正确努力或思想与行为现实的结果。
用正确的理解和实践，求得对于事物的适应，以获得控制，一般叫作科学态度。但在人的领域，不管是个人的，还是社会的，态度在变得科学的过程中是落后了。我们才开始认识到，社会不能被诅咒它的人所改变。想发展真理的人，要提高真理的人，必须认识真理本身的价值。参加它的活动，而不与它隔离，徒然指手画脚。在这一方面，佛教的密宗教导，对于世界和他自己都是站在同一立场上。心灵分析已开始深入人们的心理深处，追求可能的能量。一事是清楚的，抑制没有用，通过提高而使能量转向。传统的道德和一般显宗佛教，都以控制告终，而密宗佛教则敢于正视现实，而有意识地求得升华。
回到奇怪的神像，意思是在自我意识中用神像唤起自然存在的事物，如神的愤怒像，唤起自身的愤怒感。他如贪、痴、欲望、无知等，都是一样。一旦把它们视为自然，便把它们放入应有地位。这便是发展全面人格，然后到了最后阶段，神像不再需要，所有在身体内部有的东西，都可自由进入轨道。当自己可以自由地指挥一切，那就是自生的、自由的、免于生命轮回的，即在此时此地进入涅槃（Nirvāṇa）。