帝承上编疟论，而申明刺疟之法。举三阳三阴、五脏胃腑之疟，以及风疟、温疟，各有刺治，因名刺疟。
【足太阳之疟，令人腰痛、头重。寒从背起，先寒后热，然，热止，汗出难已，刺中，出血。】
足太阳之脉，从头下背挟脊抵腰，故足太阳之疟，令人腰痛、头重。寒从背起，病太阳之本气，故先寒；病太阳之标气，故后热。其热也，如火之，暑之然，热止则汗出多而难已。
中，中央，委中也。刺中出血，以治太阳之疟。
【足少阳之疟，令人身体解，寒不甚，热不甚，恶见人，见人心惕惕然，热多汗出甚，刺足少阳。】
恶，去声，下同。解，犹懈惰，枢转不力也。足少阳之脉，行身之侧，枢转营运，疟病则枢转不力，故令人身体解。枢转在中，以司开合，开出为阳，合入为阴，阴阳皆虚，故寒不甚，热不甚，少阴阳气不足，故恶见人，见人则心惕惕然，既见而心惕惕，则热多，汗出甚，当刺足少阳，以治少阳之疟。
【足阳明之疟，令人先寒洒淅，洒淅寒甚，久乃热。热去汗出，喜见日月光火气，乃快然，刺足阳明跗上。】
《经脉》论云，足阳明是动，则病洒洒振寒。故足阳明之疟，令人先寒洒淅，洒淅寒甚，寒久则乃热，热去则阴阳和，故汗出。阳明虚，故喜见日月光火气。喜见者，得之乃快然也。当刺足阳明跗上之冲阳，以治阳明之疟。
【足太阳之疟，令人不乐，好太息，不嗜食，多寒热、汗出，病至则善呕，呕已乃衰，即收之。】
好，去声。足太阴疟病，脾脉不上注于心，故令人不乐。脾气不上交于肺，故好太息。脾胃不和，故不嗜食，脾气不充于肌腠，故多寒热。脾土内虚，水津外泄，故汗出。疟病方至，正气不能上行外达则善呕，呕则太阴之气，从下而上，故呕已，乃衰；病衰，当即取太阴之经而刺治之。
【足少阴之疟，令人呕吐甚，多寒热，热多寒少，欲闭户牖而处，其病难已。】
足少阴疟病，阴寒上逆，故令人呕吐甚，从阴出阳，水火主气，故多寒热，气越于外，阳盛阴虚，故热多寒少。少阴神气，热甚而虚，故欲闭户牖而处，阴阳水火皆病，神气复虚，故其病难已。病难已，故不言刺也。
【足厥阴之疟，令人腰痛，少腹满，小便不利。如癃状，非癃也，数便，意恐惧，气不足，腹中悒悒，刺足厥阴。】
数，音朔。足厥阴之脉，合督脉而上行，故足厥阴之疟，令人腰痛，其脉过阴器抵小腹，故少腹满。
少腹满，则小便不利。小便不利则如癃状。如癃状，究之非癃也。数便，则小便少而不利尔。
生阳之气，根于厥阴，阴极而阳不生，故意恐惧，意恐惧则气不足，气不足不能上出于阳，故腹中悒悒。悒悒，郁而不舒也，当刺足厥阴以治厥阴之疟。
【肺疟者，令人心寒，寒甚热，热间，善惊，如有所见者，刺手太阴阳明。】
间，去声，下间日之间同。肺，天也。心，日也。肺疟者，令人心寒，天日虚寒也。天日为阳，故寒已而甚热，热间则气血皆虚，故善惊。其惊也，如有所见者，当刺手太阳，兼及手阳明，而治其肺疟焉。
【心疟者，令人烦心甚，欲得清水，反寒多，不甚热，刺手少阳。】
心，火也。火热则烦，故心疟者，令人烦心甚，心烦既甚，欲得清水以济其热，得水则真火被却，故反寒多而不甚然，当刺手少阴，而治其心疟焉。
【肝疟者，令人色苍苍然，太息，其状若死者，刺足厥阴，见血。】
苍，青色，肝木色青，故肝疟者，令人色苍苍然，肝脉上注于肺，肝气不上，故太息，色苍苍而太息，其状若死者，当刺足厥阴，见血，而治其肝疟焉。
【脾疟者，令人寒，腹中痛，热则肠中鸣，鸣已，汗出，刺足太阴。】
脾主寒湿，故脾疟者，令人寒。腹为脾部，脾寒，故腹中痛，脾土有湿寒之气，有湿热之气，故热则肠中鸣，鸣已则湿热外行，故汗出，当刺足太阴，而治其脾疟焉。
【肾疟者，令人洒洒寒，腰脊痛，宛转，大便难，目然，手足寒，刺足太阳、少阴。】
肾为寒水之脏，故肾疟者，令人洒洒寒。腰者，肾之府。肾病，故腰脊痛。腰脊痛则转输不利，故宛转。灵枢五邪篇∶云邪在肾，则骨痛阴痹，大便难。至真要大论云∶大便难，阴气不用。故肾疟，而大便难。骨之精为瞳子，肾主骨，故目然。，摇动不明也。下焦生阳之气，不充于四肢，故手足寒，当刺足少阴，兼足太阳而治其肾疟焉。
【胃疟者，令人且病也，善饥，而不能食，食而支满，腹大，刺足阳明太阴，横脉出血。】
且，姑且也。且病，病而将愈之意。横脉，络脉也，经直络横之意。五脏疟病，至于胃腑，则从阴出阳，其病将愈。故胃疟者，令人且病也，将愈未愈，故善饥而不能食。脾胃之络脉不和，故食而支满，腹大，当刺足阳明，兼足太阴之横脉，而刺出其血焉。
【疟发，身方热，刺跗上动脉，开其空，出其血，立寒，疟方欲寒，刺手阳明太阴、足阳明太阴。】
空，孔同。此复申明胃疟之义。跗上动脉，足阳明冲阳之脉也。胃疟之发，其身方热，当刺足跗上，阳明冲阳之动脉，摇针以开其穴孔，泻出其血，则身立寒。胃疟之发，身方欲寒，此阳明之气，内合太阴，故当刺手阳明兼手太阴，足阳明、兼足太阴也。
【疟脉满大急，刺背俞，用中针，旁五俞，各一，适肥瘦，出其血也∶疟脉小实急，灸胫少阴，刺指井。】
此言经脉之疟而有五俞之刺法也。中针，不大不小之针也。，胁旁连背处也。疟脉满大急，经脉之气有余也。五脏之俞，皆在于背，故刺背俞。五脏之俞，在背两行，两行之外，复有两行，所谓也，肺曰魄户，心曰神堂，肝曰魂门，脾曰意舍，肾曰志室，故用中针，旁五俞，各刺其一。肥者，深刺之。瘦者，浅刺之，适肥瘦，以为刺，而出其血，以泻经脉之有余也。疟脉小实急，经脉之气不足也。有余泻之，不足补之。脉小，正气虚也，故当灸胫少阴之太溪，以启生阳之气。
实急，邪气实也，又当刺足小趾至阴之井穴，先灸后刺，助正散邪之法也。
【疟脉满大急，刺背俞，用五俞背俞各一，适行至于血也；疟脉缓大虚，便宜用药，不宜用针。】
上文刺背俞，旁五俞各一，乃合背俞俞而皆刺之，故于此复明之，所谓疟脉满大急，刺背俞者，乃用中针，五俞与背俞各刺其一。适肥瘦以行针，而至于出血也。疟脉缓大虚，承疟脉小实急，而言疟脉不急而缓，不小而大，不实而虚也。如是，盒饭补之，不当泻之，故曰便宜用药，不宜用针，又不但先灸后针也。此承上文而申明之也。
【凡治疟，先发如食顷，乃可以治，过之则失时也。】
凡治疟者，统承上文刺法而言也。先发如食顷，乃可治者，治之宜先也。过之者，过其食顷之时，则为失时，失时而治，治无益也。
【诸疟，而脉不见，刺十指间出血，血去必已，先视身之赤如小豆者，尽取之。】
诸疟者，统承上文疟病而言也。脉不见者，不见满大急、小实急、缓大虚之脉也。病不在脉，但当刺手十指间，井穴，出血。血去心已。更当先其未发之时，视身之皮肤赤点，如小豆者，尽取而刺之。夫所出为井，皮肤主表，病不在脉，故如是以刺之。
【十二疟者，其发各不同时，察其病形，以知其何脉之病也。先其发时，如食顷而刺之，一刺则衰，二刺则知，三刺则已，不已，刺舌下两脉，出血；不已，刺中盛经，出血，又刺项以下侠脊者，必已。舌下两脉者，廉泉也。刺疟者，必先问其病之所先发者，先刺之，先头痛及重者，先刺头上，及两额两眉间，出血；先项背痛者，先刺之；先腰脊痛者，先刺中，出血；先手臂痛者，先刺手少阴，阳明十指间；先足胫痛者，先刺足阳明十指间出血。】
上文三阳三阴五脏胃腑，合十二经脉，故曰十二疟者，其发各不同时，当先其时，而察其病形，以知其何脉之病也，知其病之所在，更当先其发时，如食顷而刺之，刺之得宜，一刺则衰。衰，邪气少去也。二刺则知。知，小便利，腹中和也。三刺则已。已，病邪皆去，正将复也。设三刺不已，更刺舌下之两脉，出血，刺两脉不已，更刺中盛经，出血，又刺项以下侠脊者，其病必已。申明舌下两脉者，廉泉也。夫一刺二刺三刺之刺疟者，必先问其病之所先发者，先刺之，如先头痛及头重者，先刺头上，以治其痛，及两额两眉间，出血，以治其重。先项背痛者，先取项背而刺之。先腰脊痛者，先刺太阳之中，出血。先手臂痛者，先刺手少阴、阳明，在手十指间之少冲、商阳。先足胫痛者，先刺足阳明，在足十指间之厉兑，出血。此统承三阳三阴、五脏胃腑十二经脉之疟，而言刺治之宜先也。
【风疟，疟发，则汗出恶风，刺三阳经背俞之血者。】
风疟，因风病疟也。疟发则汗出恶风，风伤太阳之肌腠也。太阳，三阳也。刺三阳经背俞之血者，所以治太阳之风疟也。
【痛甚，按之不可，名曰附髓病，以针，针绝骨，出血，立已。】
附，旧本讹附，今改。髓痛甚，因风而痛也。按之不可，痛在骨也。髓藏于骨，故名曰附髓病。《经脉》论云，胆足少阳之脉，直下抵绝骨之端，是主骨所生病者。
故以针，针少阳之绝骨，出血，立已。
【身体小痛，刺至阴。诸阴之井，无出血，间日一刺。】
身体小痛，不若病甚也，痛不在骨，在太阳之通体，故刺太阳经之至阴。不言出血者，以诸阴之井，无出血。至阴之穴，交于涌泉，阴可知矣，且当间日一刺。
【疟不渴，间日而作，刺足太阳，渴而间日作，刺足少阳。】
间日一刺，其疟亦必间日而作，太阳之上，寒气主之，故疟不渴，间日而作者，刺足太阳少阳之上，火气主之，故渴而间日作者，刺足少阳。
【温疟汗不出，为五十九刺。】
五十九刺，见水热穴论，温疟汗不出，是邪气藏于肾，不能外出之阳，故为五十九刺，以泻少阴肾脏之热，而发越于外。凡此，皆刺疟之法，所以承上编而申明之。