藥性目錄
草部
人參沙參 天門冬麥門冬 地黃 術（白朮、蒼朮） 黃耆 甘草（梢節） 菊花 菖蒲 遠志 黃精 山藥 五味子 肉蓯蓉 鎖雨 菟絲子 牛膝 威蕤 苡仁 石斛 巴戟大 破故紙 芎藭 當歸 芍藥（白芍、赤芍） 益母草 車前子（葉、根） 蒲黃 續斷 骨碎補 蒺藜地膚子 決明子 丹參 玄參 茜根 茅根 艾 地榆 大小薊 紅花 牡丹皮 鬱金 薑黃 延胡索 香附 旱蓮草 劉寄奴 柴胡 前胡 黃連 胡黃連 黃芩 草龍膽 防己 葛根（葉、花） 瓜蔞仁（根） 苦參 青黛 茵陳蒿 知母
貝母 地骨皮 紫菀 百部 款冬花 馬兜鈴 桔梗 苧根 蘆根 羌活 獨活 升麻 細辛 防風 乾薑 生薑 麻黃 白芷 藁本 天麻 蒼耳 秦艽 狗脊 白鮮 水萍 木賊 豨薟 附子 烏頭 天雄 蓽撥 半夏 天南星 何首烏 威靈仙 仙茅 白附子 高良薑 萆薢 葫蘆 白頭翁 阿魏 木香 茴香 肉豆蔻 白豆蔻 草豆蔻 砂仁
蓽澄茄 澤瀉 旋覆花（開葉） 木通（通草） 瞿麥 百合
紫草 燈心草 酸菜 石韋 海藻 澤蘭 昆布 甘遂 大戟 澤漆 芫花 商陸 牽牛子 蓖麻子 海金沙 白葛
常山 淫羊藿 續隨子 鶴蝨 紫河車 馬鞭草 蛇床子
王不留行 牛蒡子（根葉） 青蒿 藜蘆 射干 山豆根 白蘞 白及 羊蹄根（子） 百草灰 金星草 蒲公英 穀精草 夏枯草 山慈姑 千里光 金銀花 貫眾
木部
桂（肉桂 桂枝 桂心 柳桂） 槐實（枝花） 柏實（葉） 松脂（節花） 茯苓 茯神 琥珀 柳 枸杞 酸棗 梔子 黃柏 竹葉（淡竹、竹瀝、竹茹、苦竹） 楮實 山茱萸 五加皮 杜仲 女貞實 桑根白皮（葉枝、皮椹、皮中汁） 桑寄生 益智子 乾漆 蔓荊實 牡荊實（荊瀝） 辛夷 蕤核 鉤藤 秦皮 密蒙花 丁香 蘇合香 沉香 藿香 龍腦香 安息香 乳香 沒藥 檳榔 枳殼 枳實 厚朴 茗茶 烏藥 巴豆 皂莢（皂角刺） 大腹皮 豬苓 郁李仁 吳茱萸 蜀椒（目） 胡椒 梧實（皮根） 訶黎勒 麒麟竭 紫葳 松煙墨 天竺黃 蘇方木 棕桐 楓香脂（大楓子） 蕪荑 雷丸 五倍子 樗白皮 沒石子 木鱉 金櫻子
菜部
黃蜀葵（子） 萊菔根（子） 白芥子 瓜蒂 馬齒莧（並子） 茄根（茄蒂） 胡荽 蓼（馬蓼 水蓼） 蔥白 韭子蒜 荊芥 紫蘇子 香薷 薄荷 絲瓜
果部
蓮肉（蒂藕節） 雞頭實 覆盆子 山楂 陳皮（青橘葉、核、青皮） 大棗 柿 梅實 桃仁（花葉） 杏仁 龍眼 荔枝核（肉） 木瓜實 安石榴 梨 胡桃 枇杷葉 沙糖 草果
谷部
胡麻 白油麻（油） 麻子 生大豆（大豆黃卷、豆豉） 赤豆 白扁豆（花）綠豆 粟殼 粟米 陳廩米 糯米 大麥（麥芽） 小麥（浮麥） 神麯 酒（糟）醋 飴糖
石部
丹砂 雲母 陽起石 膽礬 空青 禹餘糧 赤石脂 硯石 綠礬 芒硝 朴硝 玄胡 食鹽（戎鹽） 無名異 滑石 石膏 寒水石 雄黃 雌黃 石硫黃 水銀（輕粉） 蜜陀僧 金銀 珊瑚 硇砂 鵬砂 磁石 砒霜 鐵（鐵鏽、秤錘、鐵花粉） 鐺墨 赤銅屑 銅青 自然銅 古文錢鉛丹粉錫 伏龍肝 石灰 石蟹 代赭 青礞石 花乳石臘雪秋露
獸部
龍骨 象牙 牛黃 牛角腮（髓、肉、膽、乳） 阿膠 鹿茸（角、角膠、髓、肉、腎） 熊膽 麝香 犀角 羚角青羊肝膽（肉） 虎骨（睛） 壯狗陰莖（頭骨、血肉） 兔頭骨（肝、肉、腦） 豚卵（懸蹄、四足、膽、肉、心、腎、肚） 膃肭臍
禽部
丹雄雞（冠、血、腸、䏶胵、卵、白、黑雌雞、黃雌雞、蛋）
白鴨 雀卵（肉、白丁香） 夜明砂
蟲魚部
石蜜 蜜蠟 露蜂房 白蠟 桑螵蛸（桑蟲） 蟬脫 木虻 斑蝥 蜻蛉 蜣螂 蜘蛛 蝟皮 牡鼠（兩頭尖） 五靈脂
白殭蠶（原蠶蛾、蠶砂、蠶退） 蠍 蜈蚣 蛤蚧 蝦蟆（蟾酥）蝸牛 白頸蚯蚓 田中螺 牡蠣 石決明 海蛤（蚶殼） 珍珠 龜甲 鱉甲 蟹 水蛭 蚺蛇膽 蛇（蛇脫、白花蛇、烏蛇） □鯉甲 魚（鯽魚 鯉魚 鯉魚膽 青魚膽 石首魚）烏賊骨
人部
亂髮 人乳汁 人糞（糞清） 人溺 □襠（月水汁）人中白 天靈蓋 人牙 人胞