天地之道，生一气而判清浊，而清者轻而上升为天，浊者重而下降为地。天为阳，地为阴，乃为二仪。
阴阳之气，各分三品，多寡不同，故有三阴三阳之六气。然天非纯阳，而亦有三阴，地非纯阴，而亦有三阳，故天地各有三阴三阳，总之以十二矣。
然天之阴阳者，寒暑燥湿风火也，地之阴阳者，木火土金水火也。金火不同其运，是故五行彰矣。然天地气运，升降不以，阴阳相感，化生万物矣。其在天则气结成象，以为日月星辰也，在地则气化为形，以生人为万物也。
然人为万物之灵也，非天垂象，而莫能测矣。其我机理，归自然也，其非圣意，而宣悟玄玄之理。故有祖圣伏牺占天望气，及视龙马灵龟，察其形象，而密解玄机，无不符其天理。乃以始为文本画卦，造六甲历纪命曰《太始天元册文》，垂示之于后人也。以诮神农，昭明其道，乃始令人食谷，以尝百药，而制《本草》矣。然后黄帝命其岐伯及鬼臾区，以发明太古灵文，宣陈造化之理，论其疾苦，以着《内经》焉。
凡此三皇三经，命曰三坟，通为教之本始，为万法宗源，诚为天之候也。若论愈病疾，济苦保命防危，非斯圣典，则安得致之矣。然经之所论，玄机奥妙，旨趣幽深，习者卒无所悟，而悟得其意者鲜矣。完素愚诚，辄考圣经，撮其枢要，积而岁久，集就斯文，以分三卷，叙为九篇，勒成一部，乃号《内经运气要旨论》尔。乃以设图彰奥，绮贯纪倜，袭句注辞，而敷其言意。或可类推者，以例傍通，例成而陈精粹之文。诂训难明者，兼义释字音，以附之于后。虽言词鄙陋，所乘从俗，而庶览者曷为悟古圣之妙道矣。
河间刘守真谨序