一本经为三坟之书后増入名医别録有朱字墨字之分总言药之主治从未有发其所以然者兹疏直接神圣立言之防故总题之曰神农本草经疏
一药物治疗本经别録业已备悉间有未尽者参之以各名家主治故小字附列于经文之下或即于疏内叙述俾采用易稽
一药类一千二百余种品类浩繁今简治疗之必不可缺暨近地所产得于覩记者备为具疏余非必用之药及罕识难致者存而不论
一种类随土异形甚且称名未覈矧近来市肆饰伪似真若令误服遗害非浅故详辨种类以正其讹
一畏忌制使物性自然非可以意求者俱照本经列之条下至其制用之宜古法具在兹复采入俾得遵守
一证类本草所载诸方俱録入主治叅互有未当于用者已为删去其外诸书所録良方甚多必详纪述以便采取
一简误以防误用之失故有证同而药不宜同者每条后详书其害至于性淳功良有益无损一药止堪治一病者悉不复着
一目録次序悉从证类本草有部分混襍如木部之藿香菜部之假苏今为移正
一本文悉遵证类善本但是书流传已久字画谬讹颇多兹逐条参订有一二意义难通者稍为厘正如伤作疡动作痛之类
一证类本草第三十卷俱载有名未用之药今有常用之物而本经未载有拾遗载之而未详者兹列为三十卷补遗
一本文顶行立欵其附入之条有正文者仍从顶行原系附入者低字加圏以别正文
一续序例下卷俱系病药忌宜今总列应忌诸药于前以见必不可轻用
先生殚一生精力发千古神圣之奥以利万世门人李季虬氏几经叅録悉以付新安吴康虞氏刻之金陵未竟而遗焉流传于知交者西吴朱氏集而刻之不及其半然且序次弗伦考覈未审也先生以医为司命一字有讹遗祸无极遂命澄先检其存稿若干卷按部选类彚得全帙细复检阅以为定本凡续序例二卷药四百九十味用识年月书此凡例云峕天启五年嵗在乙丑六月十有一日松陵通家子顾澄先谨识