上諭一發，清流大譁，忠於職守的充軍，放棄職守，容瘋子混進宮的，不過斥革為民，天下豈有這樣顛倒的是非？陳寶琛決定上疏力爭，張佩綸得知這個消息，告訴了張之洞，他當然不會放棄這個可有所表現的機會，立刻去訪陳寶琛。
張之洞率直陳述來意，是聽到了張佩綸的話，特來求證，「我也想上個摺子，作為同聲之應。」他問，「不知意下如何？」
「自然好囉！建言的人越多，越有力量。」
「不過，」張之洞實符其名，「世事洞明皆學問」，特意叮囑：「此事只可求注意門禁，裁抑宦官之言，祈望太后自悟，不必為護軍乞恩。否則，太后盛怒之下，一激反而無益有損。」
「是了。」陳寶琛說：「當如尊意。」
「那就各自起草，明天換著看。」
「不必了，早上為妙，各自遞吧！」
於是當晚各自在燈下起諫草，陳寶琛的筆下快，振筆疾書，寫的是：
「前因午門護軍毆打太監事，下刑部內務府審辦，未幾遂有劉振生擅入宮內之事，當將神武門護軍兵丁斥革。昨者午門案結，朝廷既重科護軍毆打違抗之罪，復諭以禁門理宜嚴肅，仍當實力稽查。聖慮周詳，曷勝欽服。臣維護軍以稽查門禁為職，關防內使出入，律有專條。此次刑部議譴玉林等，謂其不應於禁地鬥毆，非謂其不應稽查太監也。諭旨從而加重者，謂其不應藐抗懿旨，亦非謂其不應稽查太監也。雖然，藐抗之罪，成於毆打，毆打之釁，起於稽查，神武門兵丁失察擅入之瘋犯，罪止於斥革，午門兵丁因稽查出入之太監，以致犯宮內忿爭之律，冒抗違懿旨之愆，除名戍邊，罪且不赦，人情孰不願市恩而遠怨？其於畏禍，孰不願避重而就輕？雖諭旨已有『不得因玉林等藐抗獲罪稍形鬆弛』之言，而申以具文，先以峻罰，兵丁有何深識？勢必懲於前失；與其以生事得罪而上干天怒，不如隱忍寬縱，見好太監。即使事發，亦不過削籍為民，此後凡遇太監出入，但據口稱奉有中旨，概即放行，再不敢詳細盤查，以別其真偽，是有護軍與無護軍同，有門禁與無門禁同！」
寫到最後一個字，手真有些酸了，陳寶琛將筆一擲，揉揉手，在火爐上烘了一會，就手倒了一杯「濃、熱、滿」的武夷茶喝。在茶煙飄漾中，細讀已寫下的一段，自覺筆勢如群山起伏，連綿不斷而一氣呵成，說理極其酣暢，而文氣不矜不伐，頗為動聽。
於是趁著文興，提筆再寫，由天棚藏火藥之事，說到太監「豈盡馴良」？歷引嘉慶年間「林清事變」，太監引賊入內等故實，再轉到前明閹寺之禍，以及本朝裁抑宦官的家法，然後提出他的看法：
「臣愚以為此案在皇上之仁孝，不得不格外嚴辦，以尊懿旨；而在皇太后之寬大，必且格外施恩，以抑宦官。」
這一揚一抑，自覺情理周洽，立言有體，陳寶琛欣欣然地，相當得意。
這就該結束了，陳寶琛略一思索，便就約束太監，恪遵定制著眼，又寫了兩三百字，歸結於「使天下臣民知重治兵丁非為毆打太監，亦非偏聽太監赴訴之詞，則群疑釋然，彌彰宸斷之公允。」寫完細看，卻又困惑，自覺總有不夠圓滿之感。
凝神細想，發現了自己的毛病，這篇文章，只論黑白，未辨是非。是非原要對照來看的，這一案護軍是而太監非，奏摺中雖已大致說明白，但實如未說，因為護軍依舊判了重刑，則是者非而非者是。這一點是非說而不爭，無非怵於威權，畏懼得禍。陳寶琛內心自慚，決定不聽張之洞的話，要為護軍乞恩。
這不必修改原摺，只要加一個「附片」就可以了。但這篇「翻案」的文章，立言更須得體，措詞更應宛轉，必得一箭中鵠。不然，小事不見聽，大事就更難講話了。
因此，他彷徨徹夜，直到窗紙上顯現曙色，方始定了腹稿，呵凍捉筆，寫了下來：
「再臣細思此案護軍罪名，自係皇上為尊崇懿旨起見，格外從嚴，然一時讀詔書者，無不惶駭。蓋旗人『銷檔』，必其犯奸盜詐偽之事者也：『遇赦不赦』，必其犯十惡強盜謀故殺人之事者也。今揪人成傷，情罪本輕，即違制之罪，亦非常赦所不原，且圈禁五年，在覺羅亦為極重。此案本緣稽查攔打太監而起，臣恐播之四方，傳之萬世，不知此事始末，益滋疑義。
「臣職司記注有補闕拾遺之責，理應抗疏瀝陳，而徘徊數日，欲言復止，則以時事方艱。我慈安皇太后旰食不遑，我慈禧皇太后聖躬未豫，不願以迂戇激烈之詞，干冒宸嚴，以激成君父之過舉。然再四思維，我皇太后垂簾以來，法祖勤民，虛懷納諫，實千古所僅見，而於制馭宦寺，尤極嚴明，臣幸遇聖明，若竟曠職辜恩，取容緘默，坐聽天下後世，執此細故以疑議聖德，不獨無以對我皇太后皇上，問心先無以自安，不得已附片密陳。」
寫到這裏，陳寶琛如釋重負。立言最難的就是這一大段，因為抗疏則必指陳缺失，措詞太軟則不夠力量，太硬則易激起反感。一開頭用「自係皇上為尊崇懿旨起見」的字樣，先撇開慈禧太后，入手是正確，以下就容易說了：
「伏乞皇太后鑒臣愚悃，宮中幾暇，深念此案罪名，有無過當。如蒙特降懿旨，格外施恩，使天下臣民，知藐視抗玩之兵丁，皇上因尊崇懿旨而嚴懲之於前，皇太后因繩家法，防流弊而曲宥之於後，則如天之仁，愈足以快人心而光聖德。」
正文只簡單扼要幾句話，就說明白了。但就像做八股文一樣，「八比」既完，應該總會前文，詠歎數句，另外附兩「小比」在後面，才是氣度從容，理趣完整的好文章。陳寶琛這樣想著，決定用兩個慈禧太后能懂的典故，補足文氣，兼以諷諭。
這不難找，只要將許彭壽、潘祖蔭所編纂，專為兩宮太后初度垂簾進講之用的《治平寶鑒》，拿來翻一下就可著筆。
陳寶琛原就想到了漢文帝和薄太后的故事，一翻《治平寶鑒》，果然有此題材，便文不加點地接著寫：
「昔漢文帝欲誅驚犯乘輿之人，卒從廷尉張釋之罰金之議，又欲族盜高廟玉環者，釋之執法奏當，文帝與太后言之，卒從廷尉，至今傳為盛德之事。臣彷徨輾轉，而卒不敢不言，不忍不言者，豈有惜於二三兵丁之放流幽繫哉？實願我皇太后光前毖後，垂休稱於無窮也。區區之愚，伏祈聖鑒。」
寫完已倦得無力再看一遍，擲筆上床，睡到午間起來，不忙漱洗，先推敲原稿，自覺相當動聽，如果慈禧太后成見不深，則天意一定可回，就怕病中肝火特旺，那就再委婉亦不會見聽。
為了躊躇難決，陳寶琛想到不妨跟張之洞商量一下，於是寫了封信，附上原稿，專差送達，註明「鵠候回玉」。結果，原稿退了回來，帶回口信：「張老爺說，另外有信給老爺。」
陳寶琛明白，張之洞必得先請示李鴻藻，所以不即答覆。到了半夜裏，陳家上下都已熄燈上床，起居無節的張之洞才派聽差敲門來送信，拆開一看，只有一行字：「附子一片，請勿入藥。」
這是隱語，知者自解。陳寶琛頗有悵然若失之感。徹夜考慮，不知這片「附子」要投不要投？想來想去，只有取決於張佩綸。
張佩綸是常相過從的，沒有三天不見面的時候。這天上午來訪，陳寶琛將原稿跟張之洞的覆信，都拿了給他看。
讀到「皇上因尊崇懿旨而嚴懲之於前，皇太后因繩家法、防流弊而曲宥之於後，則如天之仁，愈足以快人心而彰聖德」，張佩綸擊節稱賞，看完說道：「精義不用可惜！」
一言而決，陳寶琛決定附片並遞，但張佩綸還有話。
「不妨打聽一下，西聖近日意緒如何？如果肝火不旺，則『附子入藥』，必可奏功。」
「是！」陳寶琛更加快慰，「我的意思，跟世叔正同。」陳寶琛科名比張佩綸早，但因張佩綸的侄子張人駿，跟陳寶琛是同年，所以他一向用「世叔」這個尊稱。
於是又談到慈禧太后的病情。馬文植因為用藥與薛、汪不同，而太監又需索得很厲害，不堪其擾，已告退回常州原籍。目前完全由薛福辰主治，頗得寵信，經常有珍物賞賜，而且御筆賜了一塊匾額：「職業修明」。同時已由內務府另外在東城找了一處大宅，供薛福辰居住。張佩綸跟他相當熟，自告奮勇為陳寶琛去打聽消息。
到了薛福辰那裏，張佩綸直道來意，是要打聽慈禧太后，這幾日病情如何，肝火可旺？薛福辰為人伉直豪爽，也不問他打聽這些是為了甚麼原因，檢出最新的脈案底稿來給他看，上面寫的是：「日常申酉發熱，今日晨間亦熱，頭眩足軟。今交節氣，似有微感。」方子用的是：人參、茯苓、白朮、附子、鱉甲、元參、麥冬、阿膠。
「依然是大補的方子？」
「是的。」答得更簡單。
「岐黃一道，我是門外漢。」張佩綸說，「俗語有『虛不受補』的話，如今能夠進補，且為大補，自是好徵兆？」
「也可以這麼說。」
「多謝見教！」張佩綸拱拱手，起身告辭。
看這樣子，慈禧太后諸症皆去，已入調養期間，一旦潮熱停止，便距痊癒之期不遠。既然如此，便不必再費躊躇了，陳寶琛第二天便將摺子遞了上去。
張之洞得到消息，內心頗為不悅，跟人發牢騷：「他朋友的規勸，尚且不聽，如何又能期望上頭納他的諫勸？」陳寶琛聽了，一笑置之。
接著，張之洞也遞了他的摺子，第二天在朝房遇見陳寶琛，問起消息。照規矩，當日遞摺，當日便有回音，而陳寶琛那個摺子，卻無下文。
「如石投水！」他這樣答覆張之洞。
張之洞的摺子也是如此，如石投水，毫無蹤影，怕的是一定要留中了。
※※※
「留中」不錯，但並不是「不發」，慈禧太后真的如陳寶琛所奏勸的，「宮中幾暇，深念此案罪名，有無過當？」在細細考慮其事。
陳寶琛的話，自然使她感動，而更多的是欣賞。如果照他的話做，中外交口稱頌，慈禧太后聖明賢德，那不也是件很快意的事嗎？
同時她也想到制裁太監的必要，張之洞奏摺中有幾句話，說得觸目驚心，她已能背得出來了：
「夫嘉慶年間林清之變，則太監為內應矣！本年秋間，有天棚搜出火藥之案，則太監失於覺察矣！劉振生擅入宮禁，則太監從無一人舉發矣！然則太監等當差之是否謹慎小心，所言之是否忠實可信？聖明在上，豈待臣言！萬一此後太監等竟有私自出入，動託上命，甚至關係政務，亦復信口媒孽，充其流弊所至，豈不可為寒心哉？」
這些話是不錯的，安德海就是一個榜樣。李蓮英倒還謹慎，但此外難保沒有人不步安德海的後塵。這樣一再思考，她漸漸地心平氣和了。
於是她先將陳寶琛和張之洞的摺子發了下去，接著便與慈安太后一起御殿，召見軍機，第一句話便是提到午門一案。
「午門護軍打太監那件案子，照刑部原議好了。」慈禧太后特為又說：「不用加重！」
恭王自是欣然奉詔。回到軍機處，首先就找陳寶琛、張之洞的原奏來看。兩疏裁抑宦官，整肅門禁的命意相同，但張之洞的摺子，又不及陳寶琛的來得鞭辟入裏，精警動人。恭王看一段贊一段，口中嘖嘖出聲，從未見他對人家的文字，這樣子傾倒過。
看完了，他將陳寶琛的摺子，重重地拂了兩下，「噗、噗」作聲，「這才真是奏疏。」他對李鴻藻和王文韶說：「我們旗下都老爺上的摺子，簡直是笑柄！」
李王兩人都明白，是指前兩天一個滿洲御史上書言事，爭的是定興縣買賣落花生的秤規。這種瑣屑細務，居然上瀆天聽，實在是笑話。
「是！」兩人同聲答應，但內心的感觸和表面的態度都不同。
李鴻藻也是力爭這一案的，有此結果，自感欣慰，但還不足以言得意，得意的是，兩張──張之洞和張佩綸，承自己的意志，有所行動。陳寶琛雖少往還，而清流聲氣相通，亦無形中在自己的控御指揮之下。陳寶琛和張之洞的奏疏一發抄，天下傳誦，必享大名，而往深裏追究，則知隱操清議，自有宗主，所以內心興奮，臉上像飛了金似的，好生得意。
王文韶則正好相反。他的地位還不能與李鴻藻相匹敵，而是為沈桂芬擔心，從崇厚失職辱國，連累舉主，沈桂芬就一直抬不起頭來。眼看清流咄咄逼人，當然不是滋味，但清流放言高論，鋒芒畢露，還不過令人感得刺心，而於實際政務的影響，畢竟輕微。如今可不同了，慈禧太后震怒，遷延數月，王公不能爭、大臣不敢爭的午門一案，竟憑清流的兩篇文章，可以迴天，這太可怕了！