於是內務府通知敬事房，敬事房的總管不敢作主，得要跟李蓮英去商量。
「內務府來說，看六爺的意思，事情怕要鬧開來，說是長春宮，外人進不去，要辦就得先從裏頭辦起。勸咱們自己辦。」
「不就在辦嗎？好吧，」李蓮英說，「咱們就辦個樣子給他們看看。」
於是秘密查訪，我到一個有嫌疑的小太監來拷問。
被拷問的這個小太監，與案情無關，只為多言賈禍。他喜歡多嘴發議論，好幾次說過，這是李三順為了陷害護軍所想出來的花樣。這話不獨是他，大家都這樣相信，就連李蓮英亦不例外。但太監總得幫太監，光憑他不知親疏遠近，自己人壞自己人的事這一點，就該受罰，況且這是何等大事？李蓮英一再告誡，不准隨便胡說，怕傳到慈禧太后耳朵裏，興起大獄，而此人不受約束，可恨極了。
為了儆眾、也為了立威，李蓮英正好趁此機會嚴厲地辦辦。問那小太監要李三順如何設計陷害，天棚上放火藥和洋取燈，是親眼所見，還是得諸傳聞，如是傳聞，聽誰所說？
這些話如何能有確實答供，沒有便拖到空屋子裏去打，一連幾天把那人折磨得不成人形。同時，李蓮英派出人去跟內務府大臣恩承說，宮裏照恭王的意思，正在嚴加追究，但真相實在不明。被拷問的人，熬刑不過，信口開河，凡是在內廷當過差的，都有被咬一口的可能。這一下，案子便鬧大了。又說，火藥一定是外頭人放的，坐更守夜的太監，固然脫不得干係，宮門上也難逃責任。
聽得這一說，恩承自然擔心，因為內廷當差，能入寢宮的，就只有內務府承應雜差的人，案子一鬧大了，諸多不便。因此，急急忙忙跟伯彥訥謨詁去商量，約了寶鋆一起去見恭王，要求將這一案，不了了之。
說得使恭王轉變了原意的是寶鋆，他以史為鑒，談到明朝末年宮內的疑案，由於處置不善，言官紛紛上奏，有所論列。持正論的，固然不少，借此題目，黨同伐異的也大有其人。因此風波迭起，壞了大局。如今這一案要鬧開來，光是「慈禧太后寢宮發現火藥」這句話，就駭人聽聞，足以震撼人心，動搖國本。為今之計，除了加意防範之外，以無所動作為宜。
「這話倒也是。不過，宮裏太監也太不成話了。得要定個章程，切切實實整頓一下兒。」恭王又說：「李三順那一案，也催一催刑部，想辦法趕緊結了它！」
寶鋆和恩承秉承恭王的意志，分頭去辦。李三順一案，早就定讞，奉旨再行訊問，意思是嫌刑部擬罪太輕，而「八大聖人」則以為已擬得太重，堅持不肯改判，所以接到恭王的催促，仍照原擬罪名復奏。定的罪名是：「玉林從重發往吉林充當苦差；祥福從重發往駐防當差；覺羅忠和從重折圈三年；並將岳林請旨交部議處。」
這個復奏一上，慈安太后不敢拿給慈禧太后看，因為堅持原奏，毫無更改，這不是太后駁刑部，竟是刑部駁太后了。擬罪擬得對不對先不說，僅是這一點，就會使慈禧太后大動肝火，於病體大非所宜。
「刑部原樣兒端了上來，似乎也不像話。」慈安太后召見恭王說，「原摺子退回去，讓潘祖蔭重新擬吧！」
「回母后皇太后的話，潘祖蔭也做不了司員的主。」
「這是怎麼說？」慈安太后大為詫異，「堂官做不了司官的主？」
「是。刑部跟別地方不一樣。秋審處的司官，按大清律例辦案，說一是一，說二是二。引例不符，可以駁，引例引對了，誰也不能駁。」恭王自覺措詞太硬，便又把話拉了回來：
「駁是可以駁，想來母后皇太后也不忍。」
慈安太后默然。殿廷召對，這就算極尷尬的場面。恭王要談一件別的事，解消僵局，轉而易舉，但刑部復奏的這一案，便即擱置，夜長則夢多，不如趁此機會作個了斷，所以也保持沉默。
這沉默就等於逼著慈安太后開口，她嘆口氣，用近乎告饒的語氣說：「唉！誰讓她病了呢？好歹照她的意思定罪吧！」
「她」，是指慈禧太后，要照「她」的意思，那天午門值班，跟李三順發生糾紛的護軍都該處死。恭王心想，就算刑部肯奉詔定擬，自己亦須有所爭辯，因為剛才的話說得太率直，不能馬上就改口。
於是他答應一聲：「是！」從御案上取回刑部原奏，略想一想說道：「臣宣懿旨，讓刑部重擬。不過，原奏定擬各人罪名，特加「從重」字樣，請母后皇太后、聖母皇太后明鑒。」
「我知道了。」慈安太后點點頭說，「我總勸她，能勸得她聽最好。」
※※※
就在第二天──十一月初八，發生了一件比長春宮天棚上發現火藥還要怪的怪事。
是近午時分，月華門長街，來了個穿了青布面老羊皮襖的中年漢子，迤邐而南，一路東張西望，居然沒有遇到一個人。
一走走到綏祉門，往左一拐，一步一探地慢慢摸了進去，走得乏了，坐在體元殿的西配殿台階上，取下掖著黑布腰帶上的旱煙袋，用「洋取燈」燃著吸。大概是抽煙太急，嗆了嗓子，咳個不住，而且大口大口的濃痰往階前吐。
西配殿隔著一道牆，就是慈禧太后起坐之處，經過薛福辰和汪守正的悉心診治，病勢大有起色，已可隨意行動，這時正在傳膳，聽得有人敢如此大聲咳嗽，深為詫異。侍奉的太監亦多把臉都嚇黃了，趕緊奔了過去，查看究竟。
「蓮英呢？」慈禧太后很生氣地，「這還成個規矩嗎？」
等把李蓮英找到，那不知名的中年漢子已被抓住，慈禧太后由榮壽公主陪著，在窗子裏面看太監詢問那人。
「姓甚麼？」
「我姓張。」
「叫甚麼名字？」
「叫劉振生。」
「怎麼又姓劉？」首領太監劉玉祥問：「你是幹甚麼的？」
「我是太監。」
「這是個瘋子！」隨著這一聲大喝，李蓮英大踏步走上前來，伸手就打。他的身軀高大，臂長掌寬，這一下打在那人臉上，頓時就立腳不住，仰面倒下，口吐白沫，口中「嗬嗬」地不知咕嚕些甚麼。
李蓮英那一喝是個提示，關照大家將此人當瘋子看待。然而一半也像實情，看他言語顛倒，神智不清的樣子，就不瘋也是個白癡。
「捆起來！」
於是取來繩子，將這個到底不知姓張還是姓劉的白癡，橫七豎八地胡亂縛住，先抬了出去，摔在牆角再說。
「佛爺受驚了！奴才該死。」李蓮英伏地請罪，「砰、砰」磕著響頭。
受驚倒不曾受驚，生的氣卻不小，「太不成事體了，」慈禧太后很嚴厲地說：「一定得查清楚，這到底是個甚麼人？怎麼進宮來的？來幹甚麼？你起來，快去辦。」
李蓮英答應著，起身出殿。先找劉玉祥等人來商議，彼此亦都詫異，宮禁森嚴，此人何由而入？
「當然是由西花園角門進來的。」劉玉祥說，「這件事，可不能怪護軍。」
西花園在大內西北角，名為花園，已經荒廢，它的南面本是明朝玄極寶殿的原址，有一道角門，封閉了多年，從安德海打開以後，便成了太監私自出入的捷徑。按照此人出現的方位來看，劉玉祥的揣測是對的。不過，進一步探究，仍有疑問。
「可也得先進了神武門，才能進角門，沒有人帶，他能進神武門嗎？」
李蓮英這一問，便等於提供了答案。從李三順一案發生，護軍把守宮門，特別當心，像這樣一個鄉愚打扮的人，無論如何是混不進來的。但是護軍把門雖嚴，對太監卻以李三順的前車之鑒，格外客氣，所以若有太監帶領，甚麼人都可以混得進來。
「我看這裏頭有人搗鬼！」李蓮英神色凝重，「咱們自己先得查一查。火藥的案子是壓下去了，這檔子怪事已經『通天』！壓不下去的，送到慎刑司一問，甚麼都會抖露，那時候咱們可就站不住腳了。」
「是啊！」劉玉祥說，「要查，就得先問那瘋子。只怕瘋瘋顛顛，問不出個名堂來。」
「不能嚇他，一嚇神智就更不清了。我不能問，他見了我一定害怕。」李蓮英略想一想說：「找崔玉貴吧，他的花招兒多，讓他去問。」
於是找了管長春宮小廚房的首領太監崔玉貴來，說知究竟，崔玉貴滿口應承，一定可以把真相問明白，不過，他說：
「我得用我的辦法，李大叔，你可別管我。」
「我不管你。你只要能問明白了，用甚麼辦法都可以。」
崔玉貴的辦法是，不拿那人當犯人，第一步先解了縛，第二步到小廚房取來些食物，當款待好朋友似的，和顏悅色陪著食用。一面吃，一面閒談，很快地盤出了真相。那人本名叫做劉振生，不瘋不癡卻有些傻，外號就叫「劉大傻」。
劉振生的語言，雖然凌亂顛倒，但異中求同，真相大致可以瞭解。他住在西城豬尾巴胡同馬家大院，同院住著個在宮裏當差的蘇拉，姓魏，行四，每次回家，總是誇耀宮裏如何富貴繁華。劉振生便常常表示，住在「天子腳下」，又有位在天子身邊的芳鄰，此生此世，總得到宮裏去見識一番，才不枉人間走一遭。
於是有一天──不久以前的一天，魏四跟劉振生說，如果真的想進宮去逛逛，他可以帶路。只是第一，要膽大，第二，要聽他的話。
劉大傻不知天高地厚，一諾無辭，但魏四當時並未帶他進宮。直到昨天回家，才跟他約好，這天上午進宮，領入神武門，迤邐往西，繞過一帶假山，指著一道角門教他往南走，又教了他一套話，假說姓張，「從天上來」，「來放火」之類，都是魏四的教導。
聽完崔玉貴的報告，李蓮英切齒罵道：「這個該死的魏四，就該千刀萬剮。」他問：「那魏四叫甚麼名字？」
「他那知道？只管人家叫『魏四哥』」。崔玉貴說，「只拿簿子來查一查，看有個住在豬尾巴胡同，姓魏的蘇拉就是了。」
「言之有理。」李蓮英即時派人到敬事房去查花名冊。
查到住在豬尾巴胡同，姓魏的蘇拉名叫魏豐，派在御花園當差。李蓮英便會同敬事房總管「移樽就教」，在御花園找了間空屋子坐定，將魏豐傳喚了來。
「你想死想活？」李蓮英第一句話就這樣問，聲音平靜，但臉上卻蘊含著殺氣。
魏豐倒也膽大沉著，陪笑問道：「李大爺，你說甚麼，我不大明白？」
「送你到慎刑司，你就明白了。」李蓮英有些不耐煩，「我沒有工夫跟你蘑菇！你想活呢，把你幹的好事，一字不准瞞，都說出來，我給你盤纏，到那兒躲一躲。你想死呢，我也給你一個痛快，馬上我就上去回明瞭，一頓板子送你回姥姥家。我再說一句，我沒有工夫跟你磨，你只要支吾一下兒，我拍腿就走！」說著，便站起身來。
魏豐這才感到事態嚴重，只好實說，是受了一批年輕好事的太監，包括李三順在內的教唆，有意騙劉振生進宮，為的是好坐實了護軍失職的罪名。
李蓮英言而有信，果然給了他五兩銀子，讓他避到京東原籍，然後在敬事房的冊籍上記下一筆：「蘇拉魏豐自八月初五起准假十日。」同時將劉振生送到內務府慎刑司去審問。
那裏的官員自然不會像崔玉貴那樣，好言好語哄著他吐露真相，疾言厲色之下，嚇得劉振生越發傻了，滿口胡說，不知所云。內務府司官卻又不敢動刑，怕刑傷過重，一命嗚呼，擔不起這個干係，只好復奏，說這劉振生形似瘋顛，口供不明，但闌入宮禁，案情重大，請旨交刑部審訊。
復奏未達御前，慈禧太后已將李蓮英喚來，問過案情。李蓮英將魏豐遣走，原意是隔斷線索，不使事態擴大，但卻並無嫁禍護軍之意。因為魏豐的請假，到底是「倒填年月」的假把戲，瞞上瞞不住下，如果硬說護軍門禁不嚴，可能護軍會據實陳奏當時的情形，而魏豐當天是在宮內，亦有許多人見過，一手遮不住所有的耳目，破綻畢露，反見得作偽情虛。
因而回答得含含糊糊，留下好些彌縫的餘地。
「這是個瘋子，不知道怎麼混進來的？」他說，「奴才在想，總有甚麼人一時疏忽，無意之間把這個瘋子帶了進來。這也不能專怪那一個人，如果各處值班太監都能實心辦事，處處留意，這個瘋子怎麼樣也到不了裏頭。奴才首先就該自請處分。」
「與你不相干。」慈禧太后說，「第一關是神武門的護軍，再就是各處值班的人，都該罰。」
「是。」李蓮英趁機攬權，但不便明奏，「奴才請旨，宮內各處，應該好好兒稽查整頓，決不能再生這些事故。萬一真的驚了聖駕，奴才死無葬身之地。」
慈禧太后深深點頭：「就派你！切切實實查一查，有不稱職的，馬上就換。」
「奴才不敢推辭。不過，奴才斗膽，請佛爺當面諭知敬事房總管太監，奴才好放手辦事。」
「我知道。」慈禧太后又將內務府的復奏交了給他：「你到東邊去說，說我的意思，派軍機跟內務府，會同刑部審問。」
李蓮英當即到鍾粹宮面陳其事。慈安太后自然照辦，第二天面諭軍機。於是劉振生便由內務府移送刑部。刑部尚書潘祖蔭大為頭痛，午門的案子未了，神武門又出了亂子，依然是牽涉到護軍與太監，亦依然是棘手之事。
但秋審處的司官，卻欣然色喜，認為天賜良機，可了午門一案。因為闌入宮禁，竟到了太后寢宮，這瘋子自是必死無疑，而守門護軍與太監，只要不是有意謀逆，則亦不過斥革軍流的罪名。但案情的輕重，與午門一案，大不相同，兩相對照，午門一案定罪已嫌過分，慈禧太后如果明理，就決不會再作苛求。
潘祖蔭一聽這話，大有道理，愁懷一去，親自先提劉振生訊問。陪審司官都是好手，問話都在關節上，所以不多片刻，便已真相大明，攜著口供單到恭王府去請示。
「奉旨會審，請六爺的示下，軍機上是派那一位？部裏好發通知。」
「讓佩蘅去吧！」恭王拿著口供單，卻並不看，問潘祖蔭說，「是太監想害護軍不是？」
潘祖蔭笑了，「凡事瞞不過六爺。」他說，「有個姓魏的蘇拉，把這個瘋子騙了進來闖禍。」
「那得追！由你那裏直接行文，跟敬事房要人。」
「刑部跟宮裏從無公文往來，還是得行文內務府。」
「那也可以。」恭王特意叮囑：「措詞要嚴厲。」
等潘祖蔭回部，說與屬下，承辦司員手段老到，將行文內務府，要姓魏的蘇拉到案一事，擱在一邊。先傳訊當日神武門值班護軍，多方研求，確證不誤，才通知內務府，詳細載明魏蘇拉的年歲相貌，指出他是案中極有關係的要犯，「請即日押送刑部，歸案嚴訊。」
刑部辦此案的經過，李蓮英不斷在打聽，同時也知道恭王主張嚴辦，看來這一案要想照原來的辦法搪塞，不易辦到，如果魏豐被逮到案，審明實情，則有意作偽袒護的用意何在？頗難分辯。所以他又在敬事房的檔籍上改動了一下，註明魏豐是出事當日，請假出宮。這樣就比較接近事實，即有破綻，也易於彌補。
於是等內務府轉來公事，敬事房便照此申復，辦好公文拿給李蓮英看時，他卻又有顧慮。
「咱們做事不能顧前不顧後。」他問：「這封公事，到了刑部，想想看，人家會怎麼辦？」
「自然是抓魏豐到案。」劉玉祥說，「如果是刑部行文到直隸總督衙門，一層層轉下去，還得有些日子，就怕軍機上直接通知步軍統領衙門派人到京東，那可一抓就著。」
「就是這話囉，我看魏豐是逃不掉了！與其將來等他有了口供，再來要人，倒不如咱們先送幾個去。」
「這話說得是。」劉玉祥說：「軍機奉旨，派的寶中堂會審，這個老頭兒好說話，大事化小，總有幾分把握。」
「我正就是這個主意。就這麼辦吧！」
於是根據崔玉貴在劉振生那裏哄出來的真話，將教唆過魏豐的太監中，找了幾個平日辦事不力的，直接移送刑部。公文當然也改過了，自己為自己渲染了一番，說是如何細心查究，追出根由，但對誑騙劉振生進宮的原因，卻一再申言，是那些太監愚昧糊塗的戲謔，「並無他意。」
送出公事，李蓮英親自去看參與會審的內務府大臣恩承，話中表示投鼠忌器，此案如果辦得過嚴，牽連太廣，深怕人心震駭。同時太監們惶惶不安，或許亦會激出其他事故，希望恩承向寶鋆進言，速速了結。
太監在統屬上歸內務府管，所以恩承就為本身的利害，也得聽從李蓮英的話，向寶鋆一提，頗以為然。在刑部，正好依律從輕，有助於了結午門一案，因而亦欣然同意，等將魏豐逮捕到案，問了兩堂，便即奏復結案。
這一案共分為三起來結，第一起是當日神武門值班的護軍統領載鶴，交部嚴議，該班章京及兵丁革斥。第二起是魏豐及教唆他騙劉振生進宮，還有劉振生所經各處值班失察的太監，依照罪名輕重，分別摘頂、罰銀、斥革、責打、發遣等處分。這兩起奉懿旨裁決後，當日執行，發遣的由護軍立即押解出宮。
第三起專為處置劉振生一個人，以「素患瘋疾，混入宮禁，語言狂悖，實屬罪無可逭」的罪名，被判處了「絞立決」。在刑部大獄內，一條繩子，三收三放，冤冤枉枉送了一條命。
於是刑部接著處理午門一案，依舊照原來的擬議復奏。這已經是瘋子混入長春宮的二十天以後，慈禧太后在這二十天中，病症又減了好些，所以親自御殿裁決。
「我真不明白，」她悻悻然地說，「刑部為甚麼這麼固執？」
「刑部依律辦理。請聖母皇太后明鑒。」恭王替刑部說好話，「刑部司員盡心推求，既不敢枉法，更不敢忤旨，處境很難。」
「這是護軍抗旨，不能拿一般的情形作比。」慈禧太后問道：「以前總有抗旨的例，讓他們查出來看。」
恭王答應著，立即通知刑部查例，這一案先擱一擱，商議其他政務。很快地，刑部有了答覆：「抗旨無例，照違制例」，抗就是違。
違制除非情節重大，譬如領軍出征，不遵指授的方略，以致貽誤戎機，損兵折將，自然難逃一死，或者像崇厚那樣，擅作主張，喪地辱國，亦有取死之道。如像這一案的午門護軍那樣，是決沒有死罪的。
由於恭王及軍機大臣力爭，刑部的復奏，懸而未決。退朝之後，慈禧太后大為不樂，一口氣憋不住，派李蓮英傳諭，召見刑部及內務府的堂官。
「你們擬得太輕了。」慈禧太后面色凜然，「一定要加重！趕快重擬復奏。」
慈禧太后不按規制辦事，潘祖蔭和恩承等人，卻不敢貿然奉詔，隨即趕到軍機處向恭王請示。
如果硬頂回去，必又是一場軒然大波，恭王跟寶鋆、沈桂芬、李鴻藻商量，決定採取比較緩和的辦法，直接由刑部、內務府奉旨復奏，軍機處暫不介入，保留發言的餘地。
刑部的司官，堅持如故，但復奏的語氣，卻很委婉，同時特呈律例一冊，將有關的條文案例，分別註明。到了第二天，慈禧太后召見軍機，不再堅持護軍必須處死，但罪名是加重了。恭王看爭到這個結果，已非易事，因而承旨擬發上諭，說午門護軍毆打太監一案，刑部所擬：
「自係照例辦理。惟此次李三順賷送賞件，於該護軍等盤查攔阻，業經告知奉有懿旨，仍敢抗違不遵，藐玩已極，若非格外嚴辦，不足以示懲儆。玉林、祥福均著革去護軍，銷除本身旗檔，發往黑龍江充當苦差，遇赦不赦。忠和著革去護軍，改為圈禁五年，均著照擬枷號加責。護軍統領岳林，著再交部嚴加議處。至禁門理宜嚴肅，嗣後仍著實力稽查，不得因玉林抗違獲罪，稍形懈弛。懍之！」