在京都，庆喜的支持者只剩下以往被称为三贤侯的土佐侯山内容堂、越前侯松平春岳和伊予宇和岛侯伊达宗城而已。容堂和宗城此时仍具参与国事的资格。
不过在京都内部却批评：这三贤侯早已不是往年的贤侯，只是变节之人而已。甚至有人明说：他们已非攘夷者，而是屈服在列强武力下，卖国的开国论者。
庆喜入京后，京都的攘夷志士反应越来越激烈，甚至说出豪语：就算是大名，也不能饶赦，只要是奸侫之人，就难逃斩奸的白刃加身！
正月十日，伊达宗城的旅馆净行寺门扉上贴了一纸墨书：“老贼伊予守（宗城）听著：擅发异论，不知悔改者，将袭击其旅馆，定以违背朝命之罪，以此供奉攘夷的血祭！”
然后，到了二月一日，在庆喜旅馆东本愿寺的太鼓楼楼上，发现一个白木的三方盒，三方盒上放置了一位大夫带须的脑袋，上面有一字条，龙飞凤舞地写著：“献予一桥卿！”
庆喜调查之后，知道这个脑袋是佐幕派公卿千种家诸大夫贺川肇的。贺川原在井伊直弼谋臣长野主膳的门下，曾参予安政大狱的策划，大前天夜里，数名浪士闯入贺川家中，恐吓下人说出主人的下落，其中有名浪士捉住贺川的儿子弁之丞，正要杀掉那小孩，贺川推开卧室内墙壁出现，他说：“要杀就杀我好了！”浪士便在哭叫著的孩子面前，斩下贺川的脑袋。然后，左手丢到岩仓具视的家中，首级则献给一桥，这对不积极奉行朝命攘夷的公卿大臣们，有一种胁迫的意味。
第二天，庆喜便去找列为公卿之首，个性多疑，思想温和的近卫关白询问。他说：“既言是遵奉朝命，天皇是否知道那些公卿与浪人的激烈暴行呢？”近卫关白说：“天皇应该是不知道的。”
天皇一向讨厌那些激烈派公卿和搬弄是非的长州派志士，当然也很少跟他们亲近，所谓“朝命”、“敕旨”、“叡虑”等，都是三条实美、姊小路公知伪造的，而志士们又将三条称为“白豆”，姊小路称为“黑豆”，其实就是把他们视为工具一样的操纵而己。
关于这件事，盛怒的土佐侯山内容堂，便挟剑带著酒气，来势汹汹地到三条实美家，山内家与三条家本就有姻亲关系，山内拉起实美的领口就问：“看在姻亲的关系上，你要老实回答；你们口口声说违敕，实际上，真的是天子的话吗？”实美怕的不得了，终于吐实说：“并不是天皇的旨意！”
容堂又再逼问：“现在日本与西洋在武器上利钝相去千里，要即刻攘夷根本就是相当困难的，这种状况天皇知道吗？”实美回答：“天皇不知道！”
“为什么会这样呢⁉竟然不对天皇说真话，做为辅弼的大臣难道都如此愚昧无知吗？”
三条受不了逼问，终于哭出来了，对容堂说出实话：“容堂大人，不如此的话，我便会被那些浪士杀害的。”他吿诉容堂，自己如何受到长州派志士的胁迫，他请容堂责问他时，也替他的处境考虑。
庆喜从容堂那里听到这种事后，觉得取缔镇压聚集在京都的这群浪士，恢复京城秩序是第一要务，他便找来担任京都守护职的松平容保，指示采取强硬立场镇压，每天派遣武装巡逻队在街市巡察。
容保摇头反对，他是个生性温和的人。然而，这位警卫家的长官虽然最初是反对镇压者，终因辩不过庆喜，最后不得不同意，从此容保的一生便过著踩著志士的血前进日子。
不过，京都攘夷家的阴谋暴动，还是持续到三月四日将军家茂进京，而达到了最高潮。这天，天皇行幸到京都南部的石清水八幡宫，准备宣布攘夷之事并祈福，这天将军家茂亦得随行，他们计画：当将军登上长石台阶时，在上面的天皇便赐下攘夷的节刀，既已拿到节刀，幕府便不能再迟疑了，一定要马上进行攘夷之事，如果违背的话，将军就等于跟朝廷为敌，全天下的人便可起而攻之。
庆喜心想那一定是个圈套，平冈丹四郎也禀报说：“对方已做了安排！”平冈在处理完江户留下来的杂事后，很快便赶到京都，根据他所获得的情报，久留米水天宫的神官真木和泉是长州人的军师，久坂玄瑞等在京都的活动都是由真木所策动；三条实美所写文采焕发的诏敕，也是由真木和泉所起草的。
“真木是个非常聪明的人物呀⁉”
“聪明吗？”庆喜听到这句话多少有点反感，在江户他曾受到幕阁官员的各种批评，因为他们都怀著讨厌水户的情緖，不过庆喜并不太在意这些感情用事的评语，然而其中有一个人的评语却让他很介意，那便是在当时幕阁中唯一认识庆喜的老中久世大和守，他说：“世人都认为庆喜像神君再生，我看倒不见得，这个人不过是个聪明的人而已！”他认为庆喜虽聪明，却不堪大任。
当时，庆喜听到这个传言，很不快的想著：难道这个久世，真的了解我⁉现在，他听到平冈丹四郎，称赞真木和泉是个聪明不凡的人，庆喜心想：比聪明的话，我不会比这个久留米的神官差吧！
长州人与激进派公卿如果按原计划进行，大槪就要成功了，不过此时又冒出另种说法，说在当天要暗杀将军家茂。根源在于过激公卿廷臣中的中山前侍从忠光，忽然从京都失踪了，谣传忠光已成为长州、土州浪士的领导人，要突击天子行幸的队伍，一队挟持圣驾，要求下达诛杀将军的敕命，另一队直接刺杀将军，这个传言照当时局势看来，可能性不小。
庆喜听到这个消息后，乞求宫廷停止行幸的行程，但没有成功。为此，他又再到二条城，拜谒将军，秘密地悄声向将军陈述前因后果，要求将军为了家邦万世，这次不要参与行幸供奉之事，家茂仅是个纯洁的年轻人，听了庆喜的这个诡计显得闷闷不乐，鼓红著脸说：“这样不是不忠吗？”
不过，庆喜一而再的劝说，连幕阁官员们也被他说服，结果便定了将军当天装作感冒发烧，称病不出二条城。听到风声而反对的是京都守护职松平容保，他到二条城来，表示：“虽然有这种传言，但卑职仍会拼命保护天皇与将军的，将军是武门的栋梁，只因听到风声，便关在二条城中不敢出去，幕府的武威还能再扬震天下吗？”不过，因为庆喜仍然坚持反对，终于还是决定托病不去。
日子过得很快，终于到了文久三年四月十一日行幸当天，早晨六点，御驾就从御所堺町御门出发。
在前头骑马引导的是会津藩家老朴山主税，最后压尾的是仙台藩家老片仓小十郎。行列人数共有一万多人，从关白以下的公卿、官员，武家方面则有庆喜以下的诸大名供奉著，只有将军跟尾张侯德川庆胜因发烧而未参加。行幸之列经过鸟羽街道，穿过淀大桥，一直过了晚上八点才抵达清水的山麓，天皇便在山麓的丰藏坊休息了一夜。
庆喜也在附近找一间房子，解除衣冠束带，躺下略做休息，预定休息三、四个小时之后，在深夜十二点半，要拿著火把登山。一旦到了山上，庆喜代替将军接受节刀之事，就势在必行了。节刀是军队出征时天子亲手赐给的刀，在凯旋时要再还给天皇，古代的中国有此一习惯，而日本两代各王朝也常有这种仪式，一旦接受节刀，幕府就要以武力驱逐在开放港口的欧美人士，接下来便得面临欧美联军的报复，在各地重新开启战火。
庆喜起身，呼叫御侧用人兼番头中根长十郎的名字，这人从一桥家的上一代便已在他家服侍，庆喜说自己觉得发烧头痛，也感觉得恶心想吐，要赶快找医生，另外也吩咐中根去通知议奏，传奏等公卿，一桥庆喜生病了……。
中根点著头，表示明白庆喜的心意，退出后很快便照著庆喜的吩咐行事，住在山麓各处的公卿听到后开始大乱，这个时候生病，真是让他们太意外了，不管真病或假病，都是有很重大影响的政治行事，马上就有激烈派的公卿到庆喜住的地方探望。
“奉有敕命，马上出来参见！”然而，庆喜叫中根回答说：“究竟是什么敕命都还不知道⁉不过现在病中之身真的是无法出来受旨。”陆续有其他使者来，庆喜都叫中根用同样的话挡驾不见。
“我看还是从这个山麓离去吧！”庆喜跟中根长十郎商量，不然的话，那些人难保不会来硬拉著庆喜上山，于是庆喜就叫人备了轿子，也来不及带任何薪优卫或随从，他吩咐他们随后跟来，自己坐著轿子出了山麓的住宿处，便急急穿越过阴暗的街道，不过等他到达城南宫时，已经有超过二百名的手下先他一步到来，这夜，他就在城南宫休息。
庆喜这次的逃遁，使得洛中志士群情激昻，第六天的十七日，在三条大桥的桥畔有这样的留字：石淸几幡宫行幸之时，将军假病镇力一桥中纳言出奔，真是可恶之至，不日，这两人都将遭天诛。
这个留字让京都街市中的人都瞧见了，从文久二年以来，有无数的天诛留言出现，但直指将军与庆喜的姓名，这倒是头一遭，至于是谁贴的，也还不知道，不过留书事件后，长州侯不久就离开京城回家鄕，让人不由得不联想是长州人的杰作。
庆喜当然很不高兴，因为在留书的文字中，批评他是奸徒，并虚张声势，因循，欺骗天皇……，这些措辞实在很让庆喜难堪。
“既然这些公卿这么喜欢攘夷，就让他们去吧！”庆喜不禁恨恨的这么说，国土将变得怎么样，这些公卿都可不负责任，庆喜虽然极力忍耐，但他的自尊心受不了这种侮辱，到底是不是在虚张声势，干脆就真的开启战火，让这些人瞧瞧！
几天后，朝廷方面又来催问，到底何月何日要开始攘夷？庆喜说：“五月十日。”那天已是四月十九日，距离开战日不过二十天而己。
敕使回去后，在京都的幕府官员们都很紧张的来问庆喜：这么短的时间，来得及准备吗？庆喜听完便笑了。
“攘夷根本就是违背现实之事，怎么样也不会成功的，准备或不准备，到那天都没什么影响。”
“可是朝廷是认真的。”
“怎么样也没关系。”
而后，朝廷又遣使者来问：“能定下日子，实在是个好消息，不过对诸大名来说，是要由幕府来下达命令呢？还是由朝廷直接下达呢？”
“由朝廷下达命令的话，诸大名会乐意奉命的。”庆喜心想，朝廷一意主张攘夷，当然就由朝廷下达命令，到时朝廷自然也得承担战败及国家灭亡的责任。
“我这个不中用的人也得回到关东了，不事先准备不行的。”他将自己要离开京城之旨向关白与议奏、传奏等公卿报吿。然而，将军仍在京城，庆喜却迳自离去，在二条城的幕臣间，逐渐有非议出现，他们认为：后见职弃年仅十八岁的将军于不顾，也有人说：归根究底，庆喜也只是个聪明人而已。
不过，庆喜是有公开的正常理由的。“将军在京都，我回关东，是为了指挥攘夷大事！”一旦攘夷开始，庆喜将成为日本军的总司令官，到时江户城也就成为日本的军事、政治中心，确实是得及早做好战争的准备。
在京都常驻的笔头老（首相）板仓胜静，心中怀疑：庆喜这个人，是否真心想要攘夷呢？不过，每个人都觉得他是认真的，因为庆喜这次回关东，连水户藩家老武田伊贺守都随行，武田伊贺守是水户攘夷派的大领袖，一向是以继承水户烈公的遗志自许，世人也莫不如此认为。庆喜带著这位攘夷名士东下，谁也不会怀疑他另有打算。
东下走陆路，二十二日从京都出发，第二天二十三日住在东海道土山宿，他的随从之一公仪大目付冈部骏河守也宿在旅店中，那夜，十名刺客潜进那家旅店的庭院，用大石头敲开窗户，大喊：奸贼冈部骏州出来受死吧！在一场混战中，冈部家的家臣抵抗被杀，骏河守则趁乱逃出，安全保住一命。后来传言那是姊小路公知派来的刺客。
从桑名渡海，二十六日住在尾张热田。这夜，庆喜举止怪异，他叫人侍候磨墨，写了长短两封信，一封是写给江户的老中，开头写著：“薄暑懊热，不知衮衮诸公连日来可好……”而后，又报吿既已接受攘夷的敕命，请幕阁官员们要费心准备。
那封较短的信，是寄给在京的关白鹰司辅熙，内容是一封词意简明的辞职表。“我无法承担将军的代理职，希望辞去此职。”他在命令幕府中人执行攘夷之事的同时，让自己辞职。
（除此之外，别无他法！）其实，他在接受敕命，离开京都时，就已觉悟非如此不可。
而后，庆喜开始慢慢走东海道回江户，这也是策略之一。京都与江户间一百二十里的路程，他就花掉十六、七天，回到江户的那天，已是五月八日的夜里。第二天九日，庆喜登城宣布：向列强宣战的攘夷之日是在五月十日。
其实那就是明天的事，但庆喜什么具体作法都没说，只召集各大臣宣达敕旨，然后也不让大臣有询问的机会，很快地起身离去，回到妻子所住的水户家小石川邸。
幕府阁员面面相觑地楞在当场，他们隐隐约约地知道庆喜正在演一出很巧妙的戏，那是一出关于如何避开攘夷的戏，人人都打算要好好看著庆喜，以他的演技当然不只这一幕，接下来一定还会有好戏看的。
果然隔了四天后，庆喜再度登城，召集幕阁中的要人，对他们说：“经过考虑，我决定辞去后见职的职位了。”每个人对他宣布攘夷命令后，紧接著辞职都觉得很意外，大伙都说不出话来。
庆喜唱的这出独角戏，大家终于逐渐看淸楚了，这出戏实在是件让人觉得面目可憎的事。他奉京都旨意发出攘夷的号令，却不明白指出实行的方法，然而就在幕府组织尚未因攘夷战争而动员时，这位发号施令的人，便走出舞台退到台下，如此既不伤害自己，也不会伤害到幕府，对双方面都无害。
一桥卿真是不好惹啊！幕阁官员与大奥的女侍看了庆喜的精彩演技后，重新对庆喜另眼相看。
不过，庆喜导演的这出戏还没有结束。为了写辞职宣言，他叫下人备了笔砚，当下人要为他磨墨时，他却遣开下人，自己动手磨墨，庆喜便是这么一个凡事都自己张罗设计的人。他终于磨好浓墨，开始拿笔写信给京都的关白鹰司。
在这封信中，他陈述了辞职的理由，在尾张热田时，他也曾寄出辞职的信给鹰司，而现在为了使世人能明白自己这出戏的主题，再度书写了更详细的理由。
开头写著：“此次愚臣奉攘夷的圣旨，东归之时虽然未有必然的胜算，把著与关东之人共生死的决心回来。”而后庆喜又洋洋洒洒陈述：“幕阁中大小官员都没有一个人同意攘夷，主要也是因为他们怀疑我的动机，他们揣测我是要藉实行攘夷时的乱局篡夺天下，因而我无法贯彻敕旨。为恐辜负天朝，只有己身退却才能成全此事。现向天朝奏明此意，恳请答应。”
而关于庆喜回到小石川邸之事，他左右的谋臣，如：中根长十郎、平冈丹四郎、黑川嘉兵卫都能了解他的立场。