一、集以纪略名者，记对纲而言，略则详之反也。凡作志乘者，必先挈其大纲，然后详其节目；此班志之例，由来尚矣。兹集就事论事，无烦立纲发明。取其纪以记事之体而已，故不称志而称纪也。况澎地无文可考、无献可询，事属草创，则略而不详者，亦势之所不得不然者耳。
一、集内分十有二门，其先后次序，首天文、次地理，天尊地卑之义也。高卑陈，斯贵贱位，故次官师。官师立，然后教化行，故次文事。文教兴，则贤材出，故次人物。有文事者，必有武备，故次武备。经文纬武，由是而俗美风清，故次风俗。醇者厥心臧，必由土物爱，故次土产。物产饶，则任土作贡，故次贡赋。〔贡赋〕以人户为藉，故次户口。人户盛，则积贮不可不裕，故次仓储。仓廪实，然后知礼节，故以艺文终焉。
一、每一门类务寻源委，自觉迂蔓，无当于简洁也。但鄙意窃计，斯为草创之编，合从训话之例，俾后之作者流览今昔，知所因革，去繁就简，不亦事半而功倍乎！
一、援引典籍，或用以开端、或取以征实，势所不免。集内俱一一标出，微独知所由来，亦用以彰前贤之美也。其澎湖原有志略一本二十篇，然事多不核，集中并未引入，仅列其观海赋、文石赋二章而已。
一、澎湖岛屿向传三十有六，昔人亦祗言其概耳。以今考之，实五十有五焉。即台志载澎湖全图，方隅亦多淆舛，率皆耳食，未经身履目击之故也；余悉为更正。至于各屿水陆程途，均未的确；兹一以厅署为主，由近及远，一一注明于各屿之下，俾披图而阅者，胜概悉在目前，可以卧游而得之也。
一、水乃至便之物，昏暮叩门，求无弗与者也。兹于井泉一节，不啻三致意者，诚以澎地居瀛海之中，尽皆咸卤，又无溪涧流泉足资挹注，所得甘泉甚难；故于各澳井眼一一胪列，俾知渴饮与饥食同艰也。游海壖者，必载水以行；入岛屿者，必问泉流所自；何莫非此意也哉！
一、艺文一门，钜制鸿章虽堪千古，必其有关于澎湖者，方为采入。集中所录，仅得诸台郡志内而已。此外因澎岛题咏者，或业经问世、或尚贮锦囊，散见叠出，谅必甚富。但余限于耳目，致有遗珠，应俟搜罗；或承惠教，自当源源增入，以昭全璧。
一、祥瑞灾异，事多荒诞，如董子、刘向所说春秋多着事应，每为昔贤所议，余可知矣。况澎湖乃海心撮土，并无有所谓芝草、醴泉等类；即间或风雨期愆、阴阳道错，微灾小眚，亦与郡邑所同。似可毋庸另立门类，应从省文之例可耳。
一、澎湖旧为郑逆所踞，其僭窃逸事已备载于台郡志内，兹不复赘；庶免文字雷同，数见不鲜之诮。故与外洋番岛一并删除，概不载入。
一、谈元说空，所谓外教也。服其教者，禅林精舍，穷幽极致，遍布川原，人士亦乐与居游；此郡乘邑志所以有外教一门，以纪灵踪而志胜概也。惟澎湖一十三澳，祗有土神庙宇以供香火，并无僧尼庵寺，亦无清修道观，故兹门亦阙焉。