十月底，普济寺兴建法堂寺，公推弘一大师为“名誉主席”。
十一月，告别普济寺，先由普济山中至永春桃源殿，再乘船赴南安洪梅灵应寺，路上由传贯等法师随侍。
是月，十六日，南安晋江各县立小学校长潘北山、林高怀等前往灵应寺请偈，并以教师生活清苦、可否改业一事请教大师。大师言：“小学为栽培人才之基础，关系国家民族至关重大。小学教师目下虽太清苦，然人格实至高尚，未可轻易转途。”诸校长闻之深受教益。后大师又向一教师书赠《华严经》：“不为自己求安乐，但求众生得离苦。”
是月，在南安灵应寺作《受八关斋戒法》一文。
一九四一年一月，继续留住于南安灵应寺。
二月，痔疾发作，仍滞留于南安。
四月，佛诞节后，是大师亡母八十冥诞，大师终日为其母诵经祈祷。
五月，应檀林乡福林寺之邀，与传贯、性常法师一行由陆路到福林寺“结夏安居”。
大师于三个月的结夏期间，一方面向僧众宣讲律学，并作题为《略述印光大师之盛德》之讲演，同时编撰《律钞宗要随讲别录》及《晚晴集》。
秋季，应菲律宾之华侨佛徒之邀，拟赴菲弘法，因太平洋战争将起，局势险恶，在传贯法师等人的极力劝阻下，决定改期赴菲，因而幸免于难。此后困居厦门鼓浪屿。
十一月，因泉州佛教界的恳诚邀请，再去泉州，先住百原寺，后居承天寺。
十二月，返回福林寺。九日，《药师经析疑》编毕。
一九四二年二月，欲在福林寺闭关，因种种原因未成。
三月，大师在浙一师任教时之学生石有纪已由安溪县调任惠安县县长，派曾词源专程赴晋江福林寺邀请大师去惠安灵端山弘法讲经，大师即与之约法三章：“不迎，不送，不请斋。”而后赴惠安讲经一个月。
原第２０４页图放２７１页李叔同为王吟笙所制印章
四月，弘法圆满结束，返回泉州，因身体日渐衰老，赴福林寺闭关已无可能，遂居泉州百原寺。
是年春季，著名文学家郭沫若托人向大师求字，遂书寒山诗：“我心似明月，碧潭澄皎洁；无物堪比伦，教我如何说。”书件末尾署“沫若居士澄览”。书毕委托李芳远寄赠郭沫若。
五月，在叶青眼居士及温陵养老院诸人的请求下，移居泉州开元寺温陵养老院“晚晴室”。妙莲法师代替传贯法师随侍于弘一大师左右，他是大师最后一任侍侣，大师临终将一切事宜都交由他代办处理。
此间，大师著有《持非时食戒者应注意日中之时》一文，对“过午不食”的时间作了具体界定。后又为福州恰山长庆寺手书《修建放生园池记》，这是大师的最后遗作。
七月，为李芳远第一本诗集《大方广宝诗初集》题词。
九月，于中秋之日在开元寺尊胜院讲《八大人觉经》及《净土法要》，由广义法师为之译成闽南话。这是大师一生中最后的讲经活动。
十月，二日，应转道、转逢二法师之请，为其书写大殿上的柱联，因过于劳累，旧病突发。病后第三天，为晋江中学的高中学生书写字幅多幅。六日，宣布绝食。拒医。此后，大师口述遗嘱，由妙莲法师记录：
“当我还没有命终以前，以及生命终了、死后，我的事，全由妙莲法师一人负责，其他任何人，毋用于预。”并在文后加盖印章。
原第１６７页图放２７３页弘一大师涅槃相（1942年10月13日·泉州）
大师特意叮嘱妙莲法师两点——
一、圆寂前后“助念”时，看到眼里流泪，这并不是留恋世间，挂念亲人，而是在回忆我一生的憾事，为一种悲欣交集的情境所感。
二、当呼吸停顿、热度散尽时，送去火葬，身上只穿这身破旧的短衣。遗体停龛时，要用小碗四个，填龛四角，以免蚂蚊闻臭味走上。应逐日将水加满，以防蚂蚁又爬上去，焚化时，损害了蚂蚁的生命。
此后两日，大师每天默念“阿弥陀佛”。
十月十日，上午为黄福海书益大师警训。下午，书“悲欣交集”四个大字，交付妙莲法师，是为弘一大师临终绝笔。
十月十三日，委请妙莲法师将预立遗嘱寄刘质平。是日又委托妙莲法师向夏尊、刘质平、性愿法师分寄预先书写之诀别信。
农历九月初四日晚八时，在妙莲等法师的助念声中，弘一大师于泉州温陵养老院安详圆寂。
大师圆寂七日后，火化于泉州承天寺。
一九五二年，弘一大师之骨灰及舍利分别于泉州清源山弥陀岩及杭州虎跑寺建塔，后者系由丰子恺、叶圣陶等人捐资建筑。