许文岐，字我西，浙江仁和人。祖父许子良，曾为巡抚贵州右佥都御史，父亲许联枢，曾任广西左参政。文岐于崇祯七年(1634)中进士，授南京职方郎中。江北农民起义烽火遍地，文岐辅助尚书范景文进行防御，景文十分倚重于他。后调任黄州知府，在与义军交战中，曾射杀义军首领一只虎，夺大旗而还。狱中有判重刑的囚徒七人，文岐放他们回去省亲，规定时间回狱，这七人果然守约，于是请求上官宽免其罪。
崇祯十三年(1640)，调任下江防道副使，驻蕲州。义军贺一龙、蔺养成等部聚集于蕲州、黄州一带，文岐严密防备。义军张雄飞部南渡长江，文岐命游击杨富去袭击，烧毁义军船只，迫使义军放弃这次渡江计划。巡抚宋一鹤将文岐这次军功上报于朝廷。副将一龙善用兵，文岐很器重他。曾共宿一帐中，半夜军中呼喊，文岐说：“这是奸人想乘夜逃跑。”仍卧床不动。天明，有叛兵百余夺门西逃，一龙追捕而尽杀之，全军肃然。杨富久镇蕲州，一鹤又派参将毛显文去，杨毛二人不和，弄得兵民不安。文岐召二将，于宴会上消除二人的猜疑。
崇祯十五年(1642)，左良玉的败兵南下，大肆劫掠百姓。文岐立马于江口等待，溃兵不敢侵犯。这时，起义军势力大盛，形势紧迫，人心惶惶，而文岐已升为督粮参政，正要启程赴任，见此情形不禁叹息说：“我为天子守此孤城已经三年，其职责应死守疆土，如今危急，我为何离开。”于是令其妻送母亲返乡，令杨富、毛显文率兵屯兵城外做固守的准备。不久，荆王府的将校郝承忠暗中与张献忠相通。十六年，义军大举进攻蕲州，文岐进行顽强抵抗。半夜大雪，义军攻破西门，文岐与义军巷战，兵败被执。献忠闻文岐之名，当时没有杀他，而关押在后营。与他同关在后营的还有举人奚鼎铉等数十人。文岐悄悄对他们说“：我看贼老营多是乌合之众，数万兵卒都是被俘良民，若对他晓以大义，与我们同心协力，贼可歼灭。”于是暗中联系，约定四月行动，以柳圈为号。这密谋被泄露了，献忠进行搜索，果然搜到了柳圈，将文岐斩首。这是文岐被捕七十余天后发生的事情。朝廷闻知，赠文岐太仆寺卿。