曾樱，字仲含，峡江人。万历四十四年(1616)进士。初任工部主事，又做过郎中。
天启二年(1622)，他略有提升，做了常州知府。当时御史巡按盐政、粮仓、江防、漕运及提学、屯田的都掌握着检举、弹劾地方官的大权，他们的文书天天传来，让人应接不暇。曾樱批报告给南京都察院说“：别处的郡守县令只是为一个巡按官奔走应命，只有南畿的地方官需要奔走应付几个巡按官。请全面整顿一下，清除巡按官侦查地方官过错然后让人设法赎免的陋习。”都察院长官熊明遇为此一再向巡按官申明规约。
曾樱自己为政清廉，和乐平易，不害怕承担压力。屯田御史向他要他手下应予弹劾的官员的名单，曾樱不理睬，御史故意说些吓人的话恐吓他，曾樱回答说：“我手下的官员都已经没什么可以纠举的了，只有知府罪不可言。”于是他把自己列为下等，呆在家里等候处理。抚按官急忙安慰他，他才出来办公。负责织造的宦官李实强迫各地知府向他行下级对上级的礼仪，曾樱不服从。李实传送公文就用“尔”、“汝”的称呼来侮辱他，曾樱的回文也对他使用“尔”、“汝”的称呼，到底都不肯屈服。无锡的高攀龙，江阴的缪昌期、李应升被逮捕时，曾樱送给昌期、应升盘缠钱，等到攀龙死后，曾樱撰写祭文祭奠他，设法把他的儿子和僮仆从狱中放出。宜兴的毛士龙因为触犯魏忠贤被判处戍边，曾樱暗示他逃走了。上级官员要逮捕他的家人，靠着曾樱的周旋才算作罢。武进的孙慎行触犯了忠贤，应去戍边，曾樱拖延把他放出的时间，忠贤倒台后，事情也就过去了。
崇祯元年(1628)，曾樱以右参政的身份负责防守漳南。九莲山的山贼进犯上杭，曾樱召募壮士打退了他们，在夜间捣毁他们的巢穴，把山贼基本上消灭完了。上杭的士绅、百姓为他立了一座祠庙。后来他为母亲守丧，回家去了。除下丧服后，他以原官起复，负责守护兴化、泉州二府。又升为按察使，负责巡视福宁。在此之前，红夷侵犯兴化、泉州，曾樱请巡抚邹维莲用副总兵郑芝龙的军队当先锋，果然打了胜仗。等刘香侵犯广东时，总督熊文灿想要芝龙来增援，维莲等因为刘香和芝龙间有老关系，心中猜疑，不肯派芝龙去。曾樱用一百张嘴巴保荐芝龙去，后来消灭了刘香。芝龙因此对曾樱很感激。
十年冬天，庄烈帝相信了东厂的话，认为曾樱行贿，谋求升官，就传令把他套上刑具送到京师来。御史叶初春曾经是曾樱的手下，知道他廉洁，就在上书说别的事时含蓄地提到这一点。庄烈帝下诏责问，初春于是就具体地讲说了曾樱的贤德，但也表示说不知道行贿事是从哪来的。朝廷的诏书下到福建后，巡抚沈犹龙、巡按张肯堂查阅东厂的檄书，看到上面有坏人黄四臣的名字。芝龙前往说明，说：“四臣是我派去的。我感激曾樱的恩德，怕他调走，让四臣到京城去打听消息。四臣竟胡说八道，以致惹出这样的事情来。”犹龙、肯堂就把这件事报告给朝廷，极力说明曾樱的冤屈，芝龙也上书谢罪。当地的士绅、百姓因为曾樱家里清贫，为他凑钱准备了行装，几千名老年人跟着他到京师敲登闻鼓，为他诉冤。庄烈帝传令不要把曾樱送进监房，让他住到京师的官邸中听候命令。后来剥夺了芝龙都督的官衔，让曾樱以原职去巡视海道。
不久因为衡阳、永州有很多强盗，让曾樱改任湖广按察使，负责分守湖南，给他颁发了敕命。按惯例，守道官不发敕命，是庄烈帝特意赐给他的。当时贼盗已经破坏了十多个州县，而永州的知府、推官都不能胜任自己的职务。曾樱向朝廷推荐苏州同知晏日曙、归德推官万元吉的才干。当时他们两个正因故被罢官，因为曾樱的推荐都得到了起用。曾樱接着调芝龙来剿贼，贼盗大部分归降了，这一带于是稳定下来。后来，曾樱又升为山东右布政使，负责守护登州、莱州。
十四年春天，曾樱被提拔为右副都御史。接替徐人龙巡抚他的辖区。第二年调任南京工部右侍郎，他请假还乡去了。当初山东战乱时，巡抚王永吉所辖的济南、兖州、东昌三府的州县都失陷了，他隐瞒着不往上报。后来贼兵退出，他作为收复之功报了上去。曾樱所辖的青州、登州、莱州三府没丢失几个州县，他完全如实报上去了。等后来评定功过时，永吉反而升为总督，曾樱被剥夺官职，逮进了刑部的监狱里。此后不到十天功夫，京师失陷了，贼寇释放各种囚犯，曾樱才得以逃回南方去。
后来唐王在福州称帝，芝龙推荐曾樱起任工部尚书兼东阁大学士。不久让他掌管吏部，很快又加封为太子太保、吏部尚书、文渊阁大学士。唐王驻在延平时，让曾樱留守福州。大清部队打下福州后，曾樱带着全家到海外的中左卫避难。过了五年，海岛也受到攻打，曾樱于是上吊自杀了。