曾铣，字子重，江都人。自入学作为诸生，就以才华自豪。嘉靖八年(1529)成为进士，授官长乐知县。征召为御史，巡按辽东。辽阳发生兵变，叛卒抓住都御史吕经并加以侮辱。曾铣当时巡抚金州、复州，急传檄文征召副总兵李鉴停止吕经的苛政，并为叛乱军士请求赦免。吕经被释放，急走广宁，悍兵于蛮儿等人又捉住吕经进行侮辱。就在这个月抚顺士兵也缚住指挥刘雄父子。正巧朝廷派遣侍郎林庭木昂前往勘察，乱兵很害怕。辽阳兵变的倡首人赵劓儿暗中到广宁去与于蛮儿合谋，想等到镇城官上奏章时，就集众叛乱，被总兵官刘淮察觉，阴谋未得逞。复又结盟死囚，想等到林庭木昂到达，关闭城门搞兵变。但是曾铣已经刺探得到二城及抚顺为恶之人的姓名，密授诸将，将赵劓儿等数十人同一天捕获。曾铣向皇上说：“过去甘肃大同兵变，处置得过轻。群小人说侮辱朝廷命臣，杀主帅，罪罚不过于此，于是相继作乱。现在首恶应当急诛。”于是召回林庭木昂，命令曾铣勘察核实，将诸首恶全部斩首，将首级悬挂边城，全辽大定。
提升曾铣为大理寺丞，迁右佥都御史，巡抚山东。俺答多次入侵内地，曾铣请求修筑临清外城。完工后，进为副都御史，过了三年，改派巡抚山西。经过一年敌寇没有犯边，朝廷以为是曾铣的功劳，进职为兵部侍郎，依然负巡抚之任。
嘉靖二十五年(1546)夏天，以原官总督陕西三边军务。敌寇十万多骑兵从宁塞营入侵，大肆侵掠延安、庆阳境地。曾铣率兵数千驻守塞门，而派遣前参将李珍捣毁敌巢于马梁山北，杀敌一百多人。敌寇听说后，才开始逃遁。捷报奏上皇帝，赏赐他银币。既而敌寇多次入侵，游击高极战死，副总兵肖汉败绩。曾铣上疏皇帝报告诸将的罪状，被按兵律罚治。当时河套敌寇在近塞放牧，零散骑兵往来，居民不敢樵采。曾铣正在修筑边塞，怕被他们扰乱，于是选精兵打击他们。敌寇逐渐退到北方，间或用轻骑入侵抢掠，曾铣又率领诸军将他们驱赶到远处。参将李珍和韩钦多有功劳，皇帝下诏增加曾铣的薪俸一级，赐银币有加。
曾铣向来喜好功名，又感到皇帝的知遇，更加想有所报达。考虑敌寇占据河套，长久为患中国，于是向皇帝上疏说“：敌贼占据河套，侵扰边疆将近有百年。孝宗想收复而不能，武宗想征讨而没有实现，让吉囊占据作为巢穴。他们出河套则侵略宣、大、三关，以威震畿辅；入河套则入侵延、宁、甘、固，以扰乱关中。深山大川，形势有利于敌而不利于我。封疆之臣当中还没有对陛下说要收复河套的人，因为这是军兴重务；小有挫折损失，灾祸就会接踵到来，鼎烹刀锯，前后受刑。我并不是不知道兵凶战危，而枕戈汗马，切齿痛心已经有些日子了。私下曾谋划着这件事：秋高马肥，弓矢劲利，他们聚集而进攻我们，而我们则分散而防守，让他们占上风；冬深水枯，马无隔夜之粮，春寒阴雨，土地没有干燥的地方，他们的优势渐弱，我们利用这一时机，则中国占优势。我请求用精兵六万，加以山东枪手二千，每当春夏之交，携带五十天的粮饷，水陆交进，直捣他们巢穴。步骑齐发，炮火如雷激荡，则敌寇就不能支撑。这是一劳永逸的办法，万世社稷所依赖的。”于是逐条奏上八项建议。这时，曾铣与延绥、宁夏抚臣想西从定边营，东到黄甫川一千五百里，修筑边墙防御敌寇，请求金币数十万，打算三年完工。奏章一并下到兵部。部臣感到困难，请求下令诸镇文武将吏协议。皇帝下诏书告知说“：敌贼占据河套为患中国已经很久了，我日夜惦念这件事，边臣没有分担主子忧愁的人。现在曾铣倡导恢复边疆的提议很壮烈，其令曾铣与诸镇臣子悉心研究方略，给予修边费用二十万两。”曾铣于是更加坚决。但诸巡抚延绥张问行、陕西谢兰、宁夏王邦瑞及巡按御史盛唐以为困难，长久不到一起会奏。曾铣大怒，上疏向皇帝请求，皇帝责备了诸位巡抚。等到张问行被罢后，杨守谦代替他，杨守谦的意见与曾铣相同，曾铣于是集合诸臣逐条奏上方略十八事，之后又献上阵营图八幅，皇帝以赞赏性的口气下旨让朝廷讨论。
廷臣看到皇上的意思是向着曾铣，都与曾铣说的一样。皇帝忽然拿出亲笔诏书晓谕辅臣说：“现在驱逐河套逆贼，师出果真有名吗？土兵粮食果真有余，一定能够成功吗？一个曾铣何足道之，如生民荼毒怎么样？”当初，曾铣建议的时候，辅臣夏言想依靠他来立大功，因而极力主张这样做。这时听到这话，感到非常惊骇，请求皇帝自己裁决。皇帝下令刊发手诏，普遍发给参加讨论的诸臣。当时严嵩正与夏言有仇隙，想借此来搞垮夏言，于是极力言说河套一定不能收复。暗中诋毁夏言，故意引罪请求罢职，以便激怒皇帝。不久又明显攻击夏言，他说“：向来拟旨褒奖曾铣，我都没有事先听说。”兵部尚书王以旗会集廷臣复奏，于是全部与以前说的不一样，说河套不可能收复。皇帝于是派官逮捕曾铣，调出王以旗代替他；责怪科道兵不说话，一概在朝廷上用杖拷打，停发薪俸四个月。皇帝虽然恼怒曾铣，但是并不想杀他。咸宁侯仇鸾镇守甘肃时，因阻挠边事遭曾铣弹劾，被逮捕问罪。严嵩过去向来与仇鸾亲近。他获知曾铣的好友苏纲，是夏言继妻的父亲，苏纲与曾铣、夏言曾经往来通话，于是代替仇鸾狱中草就疏章，诬告曾铣掩败不奏，克扣军饷上万，并派儿子曾淳跟着他的亲信苏纲贿赂当权者。这种话绝对没有佐证验检，但皇帝深信他的话，立即将曾淳、苏纲下诏狱。给事中齐誉等人看见皇帝非常愤怒曾铣，请求早日将他依法处置。皇帝责怪齐誉党奸避事，降级调出朝廷任职。等到曾铣押到，法司将他犯的罪比拟边帅失陷城寨所犯的罪。皇帝依照法律正条，将曾铣以交结近侍的条律斩首，妻子流放二千里，即日执行刑法。曾铣死后，夏言也坐罪被斩，而仇鸾被释放出狱。
曾铣有胆略，擅长于用兵。有一年的除夕之夜，突然命令诸将出战。当时塞上没有警情，诸将刚刚准备酒席，不想出战，贿赂铃卒，叫他向曾铣的妻子求情推缓出战。曾铣将铃卒斩首示众。诸将不得已，半夜三更披甲出战。果然遇到敌寇，并将他们击败。第二天入贺完毕，诸将请问原因。曾铣笑着说“：发现乌鹊鼓噪得不是时候，所以才知道的。”诸将都很信服。曾铣廉洁，他死了以后，家里没有剩余的财产。
隆庆初年，给事中辛自修、御史王好问为曾铣辩冤说曾铣志在立功，身遭重法，认识他和不认识他的人，至今都沉痛悼念他。皇帝下诏赠官兵部尚书，谥号襄愍。万历年间，听从御史周磐的请求，在陕西为曾铣建祠纪念。