冯祯，绥德卫人。他出身行伍，累功升至本卫指挥佥事。弘治末年，冯祯被提升为代理都指挥佥事，守备偏头关。随即充任参将，分守宁夏西路，以勇敢闻名。蜫钅番谋反后，冯祯迅速上奏报告朝廷。事情平息后，他进升为代理都指挥同知。不久，又被提升为副总兵，协守延绥。
正德六年(1511)七月，盗贼骚扰中原，皇上下诏命冯祯率所部一千五百人前去征讨。到达阜城时，遭遇盗贼。冯祯命军中士兵不要顾念首级、贪图俘获，于是大败贼军。追击数十里俘斩八百六十余人。然后进兵解除曹州之围，俘获贼首朱谅。冯祯被记功，进升为都督佥事。
第二年春，刘惠、赵钅遂扰乱河南，连陷鹿邑、上蔡、西平、遂平、舞阳、叶，纵掠南顿、新蔡、商水、襄城，又回驻西平。冯祯偕同副总兵时源，参将神周、金辅击败之。贼寇逃奔入城，官军堵塞城门。乘夜里烧死一千余人，斩首也一样多，余贼往西溃逃。巡抚邓璋等在汝宁朝见崇王，连日设宴饮酒。贼寇招集散兵，势头复振，攻陷鄢陵、荥阳、汜水、巩。河南府被围三日之后，诸军才开始聚集。贼寇驻扎在洛南，探知官军又饿又累，便出来迎战。右哨金辅不敢渡过洛河，冯祯及时源、神周正在布阵，而后哨参将姚信所部京军已经先行，失利而逃。战阵已乱，贼寇乘机进攻。冯祯下马殊死作战，援绝而死。皇上追赠他为洛南伯，赐予祭葬，并授其子冯大金为都督佥事。后来贼寇被平定，论功时，皇上又授其一子为世袭百户。第二年的这一天，冯祯死的地方风霾大作，又过一年，也是如此。伊王将此事上奏，皇上诏令官府为冯祯建祠，每年在他死的那天祭祀。随即又采纳给事中李铎的建议，每年以二石米、二匹帛，供给其家。