李仕鲁，字宗孔，濮州人。他少年聪颖、好学，足不出户达三年之久。听说鄱阳朱公迁得到宋代朱熹的传记，就前往他处，学习朱熹的学说。太祖因此得知了仕鲁的姓名。洪武年间，诏令访求精于朱氏学说的学者，有司举荐李仕鲁，李仕鲁入宫拜见皇上，太祖高兴地说：“我找你已很久了，今日得见，相见恨晚。”任命他为黄州同知，并说：“我姑且用民事来考核你，不久我会征召你的。”当年，仕鲁的政绩显著。十四年(1381)，任命他为大理寺卿。
太祖自登基后，就十分热衷于释氏之教，诏令征召东南戒德僧，多次于蒋山举行法会，应对称旨者动辄就得到金衤阑袈裟衣的赏赐，并召入禁中，赐坐并与其讲论。吴印、华克勤等人都得以提拔为大官，并把他们作为耳目。因此，他们横行霸道，谗毁大臣。全朝都没人敢说，唯独仕鲁和给事中陈汶辉相继争辩。汶辉上疏说“：古帝王以来，没有听说过缙绅缁流，杂居同事，可以相济的。现功勋元老都在考虑辞去官职，而缁流忄佥夫又乘机进谗言挑拨。如刘基、徐达受到怀疑，李善长、周德兴遭到诽谤，这和萧何、韩信遭受的猜疑又相差多远呢？希望陛下于股肱心膂，全部任用德行好、有才能的人，则天下的太平可以永保。”太祖没有采纳。诸僧怙宠，请求为释氏创立职官。于是以先所置善世院为僧录司，设立左右善世、左右阐教、左右讲经觉义等官职，都提高其品佚。道教也同样对待。度僧尼道士超过万人。
仕鲁上疏说：“陛下刚刚创业，凡意旨所向都将成为子孙万世的法程，为什么舍弃圣学而崇尚异端呢？”奏章几十次呈上，太祖仍不采纳。
仕鲁性格刚介，缘起儒学，正想推崇朱氏学说，以排斥佛教为己任。到了他的建议不被采纳以后，就请命于太祖前说“：陛下已深溺于佛教，因而臣子的忠告听不进去了。我归还陛下的笏，请求恩准我弃职回家。”太祖大怒，命武士把他抓起来，立即处死于阶下。