吴沉，字..仲，兰溪人。元朝国子博士师道的儿子，以学问品行而闻名。太祖攻下婺州，征召吴沉及同郡的许元、叶瓒玉、胡翰、汪仲山、李公常、金信、徐孳、童冀、戴良、吴履、张起敬等人会食省中，每天命二人进讲经史。不久，任命吴沉为郡学训导。
洪武初年，郡上举荐儒士，把他的名字误报成信仲，授予翰林院待制。吴沉对修撰王矨说：“名字写错了而不更改，这是欺骗。”将于朝廷辩白。王矨说恐怕引起太祖发怒。但吴沉不听从，牒请更改。太祖高兴地说“：他是诚实的人”，于是十分宠爱他，召他侍候于左右。因犯事降职为编修。给事中郑相同说“：按从前惯例，启事东宫太子，唯独东宫的官属称臣，朝臣则不这样。现在都一体称臣，从礼节上说不太合适。”吴沉斥说“：东宫是国家的大本。尊重东宫，就是尊重皇上。郑相同的说法不对。”太祖听从了他的意见。不久，因奏对失误，降职为翰林院典籍。不久，提升为东阁大学士。
最初，太祖对吴沉说：“圣贤立教有三种：一是敬天，二是忠君，三是孝亲。但各种学说分散于经卷中，没有汇集于一体，你把三种学说分门别类进行编辑。”编成书后，赐名为《精诚录》，命吴沉作序。居住一年，降为翰林侍书，改任国子博士，因年老归乡。吴沉曾著书立说，说孔子被封王是非礼。后布政使夏寅、祭酒丘..都沿用了这一说法。至嘉靖九年更定祀典。改称孔子为“至圣先师”，实际上是从吴沉开始的。