孙兴祖，濠州人。跟从太祖渡江，累积功劳担任都先锋。攻打龙江，晋升为统军元帅。攻破瑞昌八阵营，提升为天策卫指挥使。兴祖沉毅而有谋略，大将军徐达十分欣赏他。攻克泰州，因徐达的请求，命他镇守海陵。海陵是张士诚的部队入淮的要地，兴祖整治军队，操练士兵，防御十分严密。吴兵从海口侵犯，被打败，活捉了彭元帅。平江攻下后，命兴祖攻取通州，士诚守将已向徐达请降。晋升为大都督府副使，移镇彭城。徐达已平定了关、陕，旋师北向，通知兴祖于东昌汇合。随从大军攻克元都，设置燕山六卫，留兵三万人，命兴祖镇守，统领大都督分府事。大兵西征，扩廓由居庸窥视北平，徐达对诸将说：“北平有孙都督在，不足为忧虑。”于是直捣太原，详情见《徐达传》。洪武三年(1370)，率六卫的部队跟从徐达出塞，到达三不剌川，遇上敌人力战而死，年仅三十五岁。太祖哀悼痛惜，追封为燕山侯，谥号忠愍，配享于通州常遇春祠。
不久，中书行省都督同知汪兴祖兼俸事入奏。太祖听到兴祖这个名字，就叹息，命以月俸给已故的燕山侯兴祖家。以他的长子孙恪继承武德卫指挥使。很久后，历任都督佥事。二十一年，任右参将跟从蓝玉北征，到了捕鱼儿海，论功封为全宁侯，年食禄二千石，给予世袭的凭证。孙恪谨敏，有儒将风度。从征楚、蜀，回师驻守沔阳，检查各卫所军士的边防。二十五年，晋升为太子太保。不久，在山西征兵，跟从宋国公冯胜练兵。不久被召回，赐给官邸于中都。后受蓝玉党案株连而死。