耽罗，高丽之邻国。世祖征服高丽后，因耽罗是去南宋、日本的要冲，也加以注意。至元六年(1269)七月，遣明威将军都统领脱脱儿、武德将军统领王国昌、武略将军副统领刘杰视察通往耽罗等处的道路，诏告高丽国王派官引导护送。这时，高丽反元势力林衍的余党金通精逃至耽罗。九年中书省臣及枢密院臣议论说：“若先打日本，因不知日本对元朝是顺是逆，恐会留下话柄。不如先征服耽罗，然后观察日本对我朝是否顺从，从长计议。且耽罗曾来朝拜，今其国内的反叛者赶走了国王，据城作乱，我元朝举兵讨逆，也是义不容辞的事。”
十年正月，命经略使忻都、史枢及洪茶丘等率兵船大小百有八艘，讨伐耽罗的叛逆。六月，征服耽罗，于其地立耽罗国招讨司，屯驻镇边军一千七百人。其贡赋岁进毛施布百匹。后来，招讨司改为军民都达鲁花赤总管府，又改为军民安抚司。
三十一年，高丽王上书言：“耽罗之地，自祖宗以来，是高丽属国，林衍之乱既平，尹邦宝充招讨副使，以计求直属朝廷，但高丽仍希望照旧归属高丽。”帝说：“这是小事，可使归属高丽。”自此后，耽罗便再次隶属于高丽了。