皇太极在捉到洪承畴、解来盛京以后，亲自到牢里去看他。这时洪承畴尚不肯降，皇太极把自己的貂皮袍子脱了，披在洪承畴的肩上，说：“先生，不冷吗？”洪承畴瞪眼望着皇太极，望了好一会儿，叹一口气，说：“真是一位命世之主。”说罢，就跪下投降。
皇太极当天赏了他很多东西，又请他吃酒、看戏。左右的大将们颇不高兴，说：“为什么待洪承畴如此之厚呢？”皇太极问：“我们吃了这么多年的苦，为的是什么？”左右说：“为的是争夺明朝的中原。”皇太极大笑，说：“好比走路，我们都是瞎子，现在得到了一个向导，我怎么能够不开心呢？”
但是，皇太极也开心不了许久。八个月以后，在崇德八年（崇祯十六年，1643年）九月初三日的夜里，他就“无疾”而终。
这一天的上午，他还坐朝。两天以前，他还任命了三个部的新“承政”。他的年龄，才有五十二岁。他的死，有点蹊跷。
他的身体，自从所宠的宸妃在崇德六年（1641年）九月逝世以后，常常闹病，但病了不久总会复原，照样能打猎、处理政务。打猎呢，他能跑到几百里外叶赫国的故土去打。政务呢，包含对明用兵、谈和。
所谓谈和，是在松山、锦州之役以后，崇祯派了一个马绍愉来过。皇太极叫马绍愉带一封信回去，要求建立两国间的正常邦交，吉凶互相庆吊，物产互相馈遗，逃人互相交换，国界设在宁远，以双树堡属明、塔山属清，“互市”设在两地之间的连山。名义方面，称臣与否均无所谓。“自兹以往，尽释宿怨，尊卑之分，又奚较焉？”
崇祯皇帝认为皇太极措辞不逊，就写了一封严厉的敕书，叫马绍愉再去走一趟。马绍愉走到半途，怕皇太极读了敕书会生气，自己的生命不保，便一逃了事。崇祯大怒，捉了那保荐马绍愉的兵部尚书陈新甲，杀头。
从此，明、清之间不再有和平的可能。皇太极在崇德七年（1642年）十月任命阿巴泰为奉命大将军，作清军第五次的进入长城的统帅，吩咐阿巴泰完全仿照流寇的做法，到处杀人、掳人、烧房子、抢东西，把北直隶与山东两省的精华挖空。
皇太极没想到自己会死，而且在中原未得、大欲未遂之时，突然地“无疾”而终。“无疾”两字，见于清朝的官方文告。——是谁谋害了他呢？