自立军起事以前，宫崎寅藏在五月下旬随同孙中山到达香港，奉孙之命进广州与刘学询会面，探询李鸿章对脱离清廷有无决心；又奉孙之命带三万元港币到新加坡，劝康有为与孙中山合作；不料到了新加坡，便被康有为指为刺客，通知当地英政府，逮捕下狱。
宫崎寅藏与同行的一位志士吞宇（化名，真姓名待考）被关了几天，提出受审。法官问他：“你是不是一个有钱人家的子弟？”他说：“不是。”法官说：“怎么你身边有三万元（港币）之多？”他说：“本人虽穷，朋友不穷。这三万元是朋友送给我的。”法官说：“你答应给朋友什么利益，才换得了这么多银子？”他说：“利益的交换，是商人的行为。我们志士之间，不讲利益，只讲义气。”法官说：“怎么你的行李也有刀剑？”他说：“这叫做大和魂。”
孙中山在西贡接到宫崎寅藏被捕的消息，特地来新加坡营救，亲自走告英国驻在新加坡的海峡殖民地总督，说宫崎寅藏所携带的三万元是孙中山自己所有，委托宫崎寅藏携带的。总督因此而恍然大悟，晓得了宫崎寅藏是热心于中国革命的日本人，决非李鸿章所派来的刺客。
于是，法官又把宫崎寅藏提出来审问。法官说：“那三万元是你自己的么？”宫崎寅藏说：“既然朋友送了给我，当然是我自己的了。”法官笑着说：“有一位孙逸仙，却说这三万元是他的呢！”宫崎寅藏这才知道，孙中山已经向法院如此自陈。法官继续说：“议政官一致认为你和吞宇是企图暗杀中国改革家，怎么办？”宫崎寅藏表示不服，吞宇也大声抗辩。法官说：“你们的这个罪名，要将来才能判定。现在只判你们妨害治安，驱逐出境五年。”
两人出狱以后，随同孙中山再去香港。这一次所乘的，是日本船佐渡丸。不料到了香港以后，孙中山与宫崎寅藏均不能登陆。原因是，新加坡当局已经打了电报来，告诉香港当局说，孙中山等三人带了三万元在身边，意图革命。（事实上，1895年香港当局对孙中山的五年放逐令业已期满，而且新加坡的法院判决也不该适用于香港。）
孙中山原来的计划，是要在香港登岸，设法进入大陆，到惠州三洲田，亲自率领郑士良所聚集的武装同志起事。受了香港当局的如此阻碍，他只得于阴历六月二十一日在佐渡丸船上召集了一次会议，议决武装同志由郑士良统率，孙中山自己去台湾，找自称同情中国革命的台湾总督儿玉源太郎，接济军火。
在未去台湾以前，孙中山先和宫崎寅藏、吞宇同回日本。
回到日本以后，孙中山住在横滨，宫崎寅藏与吞宇住在东京芝浦，分头筹划一切。自立军起事之前不久，孙中山经由上海，去了台湾。