（一）袁總統逝世
袁總統自滇黔反抗帝制後，政務焦勞，軍事外交尤形繁劇，公府中重要會議無不躬蒞擘畫，指示方針，雖其後帝制取消，而大局依然紛擾，且南省仍堅執退位之說，不稍讓步，以故積勞成疾。五月下旬，卽傳政躬不豫，病象爲夜不成眠，晝不思食，初猶力疾視事，其後日漸危重，疊經中西醫生診治，西醫認爲尿毒症，用穿刺手術治療，亦未奏效，六月六日上午十時。遂爾逝世。聞五月杪病勢加劇時，曾召段祺瑞、王士珍等政要諸人入內，自謂不願再攬政權，交出善後數端，責令妥籌辦法，俟籌備後卽行辭職，惟所交之案，頗難籌辦，同時復派代表出席於公府會議，提出繼任交替、保證外交等項議案，飭令籌議。又聞彌留之際，告徐世昌等謂本無帝制自爲之心，而左右之人混淆黑白，遂信爲國民眞意，南方要求退位，所以未允者，實恐全國大亂，因而分裂也。八日大殮，二十八日運柩歸河南彰德，八月二十四日在河南安葬。當病革時，召武定軍若干營入京，分駐各地，以資防護，五六等日，京城人民慮駐京軍隊譁變，甚覺恐慌，嗣得逝世之耗，尤爲俶擾，物價驟昂，銀根愈緊，迨黎總統就任，乃漸平定焉。
（二）黎總統之繼任
黎副總統之繼任，實規定於元年三月公布之約法及二年十月公布之大總統選舉法中，而袁總統之遺令則謂：「本大總統遵照約法，宣告以副總統代行中華民國大總統職權。」與帝國之傳位遺詔相似，且所引者爲三年五月公布約法會議議決之約法，而因此產生之大總統選舉法，則規定副總統代行職權僅以三日爲限，是此令不特有背法律，且與事實亦多矛盾也。黎總統於七日上午十時，在東廠胡同副總統私邸行就任禮，卽日頒發就任之申令。
當袁總統未逝世以前，護國軍旣宣言認黎氏爲大總統，京外要人亦多主張請黎氏依法代任，以挽危局，卽袁總統當軍事危迫時，亦有先行請假，由副總統暫代之意，故黎氏繼任，輿情翕然，不特國民全體擁護，卽外人方面亦皆表示歡迎也。
（三）黎總統繼任後之政治施行
黎總統繼任後，卽日申令京外文武官吏均仍舊供職。十日，裁撤陸海軍大元帥統率辦事處，原辦事宜，歸陸軍部、海軍部、參謀部分別處理。十六日，申令派出軍隊一律停戰，尅期撤退。十九日，裁撤京畿軍政執法處，已結未結各案，交陸軍部核辦。
惟當日國民所希望者，爲恢復元年約法及召集國會，欲政府速以命令宣布，而政府要人對於約法之主張，殊不一致 —— 有主張直捷恢復者；有謂三年公布之約法已成爲法律，不宜以命令變更，須用法律手續恢復者；又有主張適用新法者，而以主張第二說尤爲多數。於是擬令各省長官每省遣派代表三人來京會議，旋改爲由各省於國會議員中選出三人，然均不果行。惟僅由段總理於二十二日通電各省長官暨岑春煊、唐紹儀、梁啓超、伍廷芳等氏，略謂：「恢復元年約法，政府初無成見，惟以命令變更法律，後患不可勝言。三年約法，履行已久，歷經依據，以爲行政之準，一語抹煞，則一切法令將受動搖，故不能不再三審愼。」二十三日，復致電在滬議員，徵求意見，嗣以各省覆電多主張以命令恢復，而梁啓超、唐紹儀覆電謂：「三年約法絕對不能認爲法律，此次宣言恢復，絕不能認爲變更，今大總統之繼任及國務院之成立，均根據於元年約法。一法不能兩容，三年約法若爲法，則元年約法爲非法，故三年約法非特國人所不認爲法，卽今大總統及國務院之地位，皆必先不認爲法而始能存在者也」云云。駐滬議員亦覆電促以明令廢止三年約法及附屬諸法，同時總統府及國務院疊接京外催促恢復約法之函電，日十餘起，遂於二十九日，申令憲法未定以前，仍遵行元年三月十一日公布之臨時約法，至憲法成立爲止，其二年十月五日宣布之大總統選舉法，係憲法之一部，應仍有效；又令民國三年五月一日以下所有各項條約，均應繼續有效，其餘法令，除有明令廢止外，一切仍舊。同日申令依臨時約法第五十三條，續行召集國會，定於本年八月一日起，繼續開會，並裁撤參政院暨平政院所屬之肅政廳，撤銷關於立法院、國民會議各法令，特任段祺瑞爲國務總理。三十日，改任各部總長。
七月六日，改定各省軍民長官名稱 —— 各省督理軍務改稱督軍，各省巡按使改稱省長；廢止頒爵條例、國賊懲辦條例、附亂自首特赦令、糾彈法。八日，廢止文官官秩令。十日，裁撤全國經界局，歸倂內務部辦理；改編拱衞軍爲陸軍第十三師。十二日，申令釋放政治罪犯 —— 所有以前因政治犯罪被拘禁者，一律釋放，通緝各案，亦一律撤銷。十四日，申令懲辦變更國體始禍之楊度、孫毓筠、顧鰲、梁士詒、夏壽田、朱啟鈐、周自齊、薛大可八人 —— 帝制禍首，人數頗夥，其最著者亦不僅八人，自黎總統繼任後，南方各省要人均要求懲辦，至是始明令宣布，僅以八人爲限，且聲明其餘一概寬免，然八人已先期避匿，故無一緝獲者。十六日，廢止報紙條例。十八日，廢止官吏犯罪特別管轄令、官吏犯贓治罪法執行令、徒刑改遣條例及施行細則。八月十四日，申令各省省議會，定十月一日召集。
八月一日，國會開會，黎總統詣會補行就任之宣誓。先是滇黔起義後，前被解散及停止職務之兩院議員，多聚集上海，擬在上海設立會議機關，此次續行召集，各議員多就近由上海至京，故國會得以如期集議。國會開會後，卽從事於憲法之制定，以二年憲法委員會所擬之憲法爲基礎，開憲法會議討論。國務總理及國務員亦經大總統提出，兩院先後通過，於是立法、行政兩機關均完全成立矣。