世宗雍正元年，秋八月，青海罗卜藏丹津率众内犯，命川陕总督年羹尧备兵迎击。青海自康熙三十七年内属中国，常资其力以捍准部。西藏之役，青海诸部长皆从征，以功晋封王公者甚众。至罗卜藏丹津袭和硕亲王爵，自以青海及西藏，旧皆和硕特属土，而己又顾实汗嫡孙，当回复先人霸业，总长诸部。闻帝新立，欲乘机脱中国羁绊，，乃诱诸部联盟于察罕陀罗海，令各复故号，不得称王、贝勒、公等爵，而自号达赖浑台吉以统之。又诱使青海大喇嘛察罕诺门从己，复阴约准噶尔部长策妄阿喇布坦为后援，于是青海与准部之联合成。而远近游牧剌麻二十馀万同时骚动，惟丹津之同族郡王额尔得尼及亲王察罕丹津不从，先后挈众内奔，丹津率兵追之。帝闻，命青海理事大臣侍郎常寿传谕丹津，令罢兵。丹津不奉诏，反诬额尔得尼等谋据西藏，因诸部不服，将率众与决胜负，至是已渡黄河。廷议调西宁兵，于其渡河时，邀击之于渡口，故有是命。 冬十月，命年羹尧为抚远大将军，驻西宁，相机进剿罗卜藏丹津，以四川提督岳锺琪参赞军务。丹津以沙拉图为根据地，遣兵分窥西宁附近堡驿，先兵诱执侍郎常寿、笔帖式多尔济，幽之堪布庙中。羹尧既奉诏督师，乃分兵北扼布隆吉河[1]，防其内犯；南守巴塘、里塘等地，断其入藏之路，又请敕靖逆将军富宁安，调都统穆森、吐鲁番驻防副将军阿喇衲，分屯吐鲁番及噶斯湖，绝其与准部之交通，而令锺琪自松潘至西宁，沿途防堵，于是丹津屡次遣兵分寇西宁，皆败去。时多尔济已不屈死，丹津送常寿归而上表请和，帝不许。
二年，春二月，奋威将军岳锺琪率师直抵青海之沙拉图，罗卜藏丹津遁，擒其家属，青海平。先是帝知丹津穷蹙，益趣羹尧进兵，羹尧请于四月草生时，由西宁、松潘、甘州、布隆吉河分四路进攻，锺琪则以分攻非策，愿乘青草未生时，兼程进，以捣其不备。廷议壮之，授锺琪奋威将军，专任西征事。锺琪遂以是月初八日出师，由布尔哈屯趋沙拉图，沿途歼敌哨探，直抵其帐，敌始知兵至，仓皇惊溃，自出兵至此，前后仅十五日。帝大悦，诏封锺琪三等公，羹尧及其父遐龄均一等公，晋太傅，青海悉定。
七年，春三月，以内大臣公傅尔丹为靖边大将军，出北路；川陕总督公岳锺琪为宁远大将军，出西路，往征准噶尔。初，罗卜藏丹津往投准噶尔策妄阿喇布坦，朝廷屡遣使索之，不奉诏，时西北两路之师已撤。雍正五年冬，策妄阿喇布坦死，子噶尔丹策零立，帝欲乘丧讨之，大学士朱轼、都御史沈近思皆以时未至，惟大学士张廷玉主用兵。时傅尔丹袭爵，为领侍卫内大臣，以容仪修伟，荐为帅，至是筑大将坛，率师五万行，诸蒙古藩臣皆执靮以从。都统达福力谏，帝曰：“策逆已死，噶逆新立，何云不可？”达福曰：“策逆虽死，老臣固在；噶逆亲贤，诸酋长皆感其先德，力为捍卫。我以千里转饷之劳，攻彼效死之众，臣未见其可。况溽暑未易兴师乎？”廷玉曰：“六月兴师，载诸小雅，君未知耶？”达争愈力。帝曰：“然则命汝副傅尔丹行，尚敢辞耶？”遂出师，命达福从征。
八年，夏五月，诏岳锺琪、傅尔丹回京，命侍郎杭奕禄、众佛保，偕准噶尔使臣特磊，前往议和。先是雍正七年十月，锺琪师抵陶赖、大板、斥𢰡，适策零遗特磊至，诡称已解送罗卜藏丹津前来，以闻出师而止，至是复遣特磊至京，请朝廷赦其已往，当以丹津献。帝信之，命暂缓进兵，遗杭奕禄等偕特磊往议，且诏两大将军回京，而以副将军巴赛、提督纪成斌分摄两路军事。 冬十二月，准噶尔兵犯西路阔舍图卡伦，劫牧场，总兵官樊廷等击退之。初，岳锺琪奉诏入觐，纪成斌既权西路军众，命副参领查廪领卒万人牧驼马，廪以偏裨督五十人牧放，己率众避寒山谷间，置酒高会为乐。策零乘不备，越卡伦，纵掠驼马，廪弃军走。总后曹勷闻警，率兵往救，败绩，兵兵官樊廷率副将冷大雄等，以兵二千转战七画夜，救出卡伦守兵，会合总兵官张元佐等，击杀敌兵无算，驼马牲畜悉夺回。廪见成斌，委罪于勷，成斌哂之曰：“满洲人之勇固如是乎？”收廪，将斩之，而锺琪自京回营，成斌告其故，锺琪惊曰：“君今族矣！满洲为国旧人，吾侪岂可与抗以干其怒耶？”解廪缚，以善言抚之，而委罪于勷，斩以徇，廪反恨锺琪刺骨。后总督查郎阿阅边，故廪戚也，入廪言，劾锺琪，逮狱论死，斩成斌于军，廪竟得免。
九年，夏六月，傅尔丹败绩于和通泊，副将军马赛等战死。策零遣大策零敦多布，以兵三万犯北路。先遗谍至科布多，佯为我获，诡言准部连年与可萨克交战，驼马羸弱，可袭而破。此时大队未至，其前队千馀，驼马二万，在博克托岭，距此三日程。傅尔丹欲进师，副都统定寿、海寿、侍郎永国等力谏，傅尔丹艴然曰：“国家所以无敌者，以武臣不畏死耳，君等安可蹈汉儿弱习哉？”命整军以进。主事何溥扣马谏，傅尔丹曰：“蕞尔汉儒，安识兵事？”以鞭折抶其手而去。翌日，前军至和通淖尔[2]，闻胡笳远作，毡裘四合如黑云，遂为敌军所为。傅尔丹策后军往援，前锋四千悉战役，直犯中军。傅尔丹命蒙古兵御之，科尔沁蒙古偃红旗首遁，土默特蒙古奋身入敌叠。众见白旗，谓索伦兵败，骇曰：“白纛，兵陷敌矣！”诸军遂大溃，终夜甲仗声不绝。傅尔丹举止失措，惟抚驭满洲士卒曰：“慎勿隧家声也！”于是自副将军巴赛、查弼纳以下，苏图、马尔齐、西弥赖、海兰戴豪等，先后战死，及自杀者凡十馀人。定寿、海寿、永国、何溥、达福与焉，皆一时将帅之选也，得还科布多者仅二千人。敌获塔尔岱，以皮绳穿其胫，盛以皮囊，载诸马后，从容唱胡歌返，科尔沁王匿龿符中免，以巨金贿傅尔丹，傅尔丹受贿，反谓土默特兵先败，收公沙律斩之，士卒皆忿。败报闻，帝大恸曰：“悔不听达福言！”诏以大学士马尔赛为抚远大将军，屯归化城，降傅尔丹振武将军，而以顺承郡王锡保代之。移科布多营于察罕�尔。初，岳锺琪赴傅尔丹穹庐中会议进兵，见四壁刀槊森列，问何所用，傅尔丹曰：“此吾所素习，悬以励众。”锺琪出语，人曰：“为大将者，不恃谋而恃勇，亡无日矣。”至是如所料。
十年，秋八月，和硕亲王额驸策凌大破准兵于厄尔得尼昭，准将小策零郭多布西进。策凌为元裔，自幼侍内廷，尚公主，寻携属归塔米尔河，累从征漠北有功。雍正九年九月，噶尔丹策零既败傅尔丹于和通泊，乘胜东犯喀尔喀，取道阿尔泰山南入。策凌迎击于鄂登楚勒河，大破其众。是年七月，策零遣其将小策零来犯厄得尔河，锡保檄策凌，御诸木博图。策凌既西，策零乃突袭其帐于塔米尔河，掠其子女牲畜。策凌闻警，即回师驰救，并请锡保发兵夹攻，至是大破小策零之众于厄尔得尼昭[3]。敌三万，几尽歼。而锡保之援兵不至，小策零得从推河遁去。策凌急檄马尔赛于拜达里克河，邀击之，马尔赛闭关不出，曰：“吾奉命屯戍于此，未奉退贼之命也。”军士登城，望见敌骑过者纷杂，不复成行列，请开城迎击。其副师都统李杖以鞭挥众曰：“紧闭门，越者斩！”诸将益忿。裨将傅鼐慷慨言曰：“相公奉命，遢敌归路，今豕突至此，奈何任其𩗺去？”率本部斩关出，击斩千计，而小策零已从前队过。事闻，斩马尔赛及李杖以徇，黜锡保王爵。
十二年，秋八月，降旨罢征准噶尔，遗侍郎傅鼐、学士阿克敦前往议和。策零自厄尔得尼昭大创之后，稍稍徙去，两路将军陈师边境，欲诱之使来，以便邀击。而策凌持重，究不至，至是经略鄂尔泰出巡阿克苏归，言准部未可猝灭，扰蔽中华无益，遂降旨罢兵。北路撤归鄂尔坤河，西路撤归哈密巴里坤，遣鼐等往准噶尔议清尽疆界事。计自康熙五十六年备边以来，穈饷七千馀万，劳师十六七载，至是始克有平和之希望。然至乾隆间，又乘准部之内乱，而远征军纷纷出发矣。
[1]疏勒河
[2]译言大泽
[3]光显寺